RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FOLR1P15328 257 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AKR1C4P17516 323 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GZMHP20718 246 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FBLN1P23142 703 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 F2RP25116 425 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACADLP28330 430 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CD200P41217 278 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC6A8P48029 635 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ASCL1P50553 236 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UGT2B15P54855 530 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PKIAP61925 76 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GNGT1P63211 74 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HMGCS1Q01581 520 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TPBGQ13641 420 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FHL3Q13643 280 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OXA1LQ15070 435 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACKR1Q16570 336 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AGAP6Q5VW22 663 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF529Q6P280 563 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GJB7Q6PEY0 223 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DRAM2Q6UX65 266 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DLK2Q6UY11 383 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CYS1Q717R9 158 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UNC93AQ86WB7 457 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM25Q86YD3 366 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SYT12Q8IV01 421 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SKA3Q8IX90 412 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AMER2Q8N7J2 671 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ITFG1Q8TB96 612 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SDR42E1Q8WUS8 393 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB3CQ96E17 227 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 YIPF6Q96EC8 236 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WDR34Q96EX3 536 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HPDLQ96IR7 371 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MICU1Q9BPX6 476 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KATNBL1Q9H079 304 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q9N2K0 584 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HHLA2Q9UM44 414 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TNNQ9UQP3 1299 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WDR45Q9Y484 360 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FANCAO15360 1455 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NLRP1Q9C000 1473 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZMYM6O95789 1325 aa6.46□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TAF1P21675 1872 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLXNC1O60486 1568 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CYB5BO43169 146 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HSBP1O75506 76 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2B3O76000 313 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRT33AO76009 404 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MT-CO2P00403 227 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PDYNP01213 254 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GH2P01242 217 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HIST1H2ABP04908 130 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ISG15P05161 165 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SFTPBP07988 381 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HOXB5P09067 269 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CELP19835 753 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HIST1H2ADP20671 130 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BCKDHBP21953 392 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 S100GP29377 79 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DDTP30046 118 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FMO3P31513 532 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LIPAP38571 399 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VHLP40337 213 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARL4AP40617 200 aa6.45□□□□□ -1.38
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAP2K4P45985 399 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms