RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 ASB6Q9NWX5 421 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP3-209ENST00000533069 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 VAMP5O95183 116 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 C8BP07358 591 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 PNMTP11086 282 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 AQP1P29972 269 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 MS4A2Q01362 244 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ELOA3Q8NG57 546 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 MUCL1Q96DR8 90 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 CCL19Q99731 98 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 YY1AP1Q9H869 796 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 BAG5Q9UL15 447 aa14.7□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 F8P00451 2351 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 A0A1B0GWA3 101 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 TPST1O60507 370 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 MFN2O95140 757 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 AKR7A3O95154 331 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 HTR2AP28223 471 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 PPA1Q15181 289 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 STK11Q15831 433 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 TMEM225Q6GV28 225 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ULK3Q6PHR2 472 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 CBLL1Q75N03 491 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 COMTD1Q86VU5 262 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 SPATA24Q86W54 205 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 TMEM99Q8N816 258 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 MAGIXQ9H6Y5 334 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 SELENONQ9NZV5 590 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 RASD1Q9Y272 281 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 OR5H1A6NKK0 313 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 OR2T1O43869 369 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 SMPD2O60906 423 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 TMCC2O75069 709 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 FZD7O75084 574 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 IGHV3-9P01782 118 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 CD3EP07766 207 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 NTF4P34130 210 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 RIPK1Q13546 671 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 GPAT4Q86UL3 456 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 SLC38A4Q969I6 547 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 UPB1Q9UBR1 384 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ABCA4P78363 2273 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 MPDZO75970 2070 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 A0A0B4J2E0 115 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 A0A1B0GX12 115 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 DHRS12A0PJE2 317 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 CIB4A0PJX0 185 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 M0QX08 132 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 PDLIM1O00151 329 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 HS3ST1O14792 307 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 FMO6PO60774 539 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 RAD51DO75771 328 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 SERPINA1P01009 418 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 CD99P14209 185 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 NCK1P16333 377 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ATP6V1B2P21281 511 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 P2RY4P51582 365 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 SELENOWP63302 87 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 EGR4Q05215 589 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 FAPQ12884 760 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 AAED1Q7RTV5 226 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ZNF611Q8N823 705 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP3-209ENST00000533069 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms