RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	P2RY2	P41231	377 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PRLHR	P49683	370 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	DIO3	P55073	304 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	AP1S2	P56377	157 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PFN3	P60673	137 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ERVK-8	P63133	956 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MAPK11	Q15759	364 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ELMO1	Q92556	727 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RCN3	Q96D15	328 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	WBP1	Q96G27	269 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	COX14	Q96I36	57 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TEX37	Q96LM6	180 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	NPAS2	Q99743	824 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1W2PP18	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MEI4	A8MW99	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908		M0R296	226 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MANBA	O00462	879 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	INPP4B	O15327	924 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CFLAR	O15519	480 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CLN5	O75503	358 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CIB2	O75838	187 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	C1orf105	O95561	183 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ANPEP	P15144	967 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ITIH1	P19827	911 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ME2	P23368	584 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TEAD1	P28347	426 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	IL12A	P29459	219 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GPR1	P46091	355 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GNPDA1	P46926	289 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	NUDT2	P50583	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	STX1B	P61266	288 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PSME3	P61289	254 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RCN1	Q15293	331 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CST6	Q15828	149 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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