RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	MS4A18	H0YCH9	400 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABCD4	O14678	606 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	FMO6P	O60774	539 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	UPK3A	O75631	287 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	C8B	P07358	591 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD40	P25942	277 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF83	P51522	516 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIPPLY3	P57055	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	VMAC	Q2NL98	169 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SSX8	Q7RTT4	187 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6S1	Q8NH40	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXW5	Q969U6	566 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	UPB1	Q9UBR1	384 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM64B	A6NI03	449 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014		E7EQL1	145 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	AIM2	O14862	343 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF9	O43307	516 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2T1	O43869	369 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMCC2	O75069	709 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	HLA-DOB	P13765	273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CBL	P22681	906 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLDN17	P56750	224 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	NIPAL3	Q6P499	406 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF613	Q6PF04	617 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	DTX2	Q86UW9	622 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM123	Q8N131	208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q96MF0	132 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF583	Q96ND8	569 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	OXGR1	Q96P68	337 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCHR1	Q99705	422 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARMCX1	Q9P291	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	RCE1	Q9Y256	329 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	DYNC1I1	O14576	645 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRAS	O14807	208 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT34	O76011	436 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPPA	P01160	153 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTAFR	P25105	342 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH11	P55287	796 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCALD	P61601	193 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	C18orf12	Q96KH6	178 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED4	Q9NPJ6	270 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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