RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OAFQ86UD1 273 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR4C3Q8NH37 302 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PIGKQ92643 395 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 STACQ99469 402 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 STK25O00506 426 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 BET1O15155 118 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NKX2-2O95096 273 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GLAP06280 429 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR1D4P47884 311 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TPBGQ13641 420 aa6.41□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 BAK1Q16611 211 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 Q3ZCU0 254 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SGK3Q96BR1 496 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DGAT2Q96PD7 388 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 A0A075B6Q4 140 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DAPL1A0PJW8 107 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CLDN4O14493 209 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GMDSO60547 372 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LYPD3O95274 346 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NGFRP08138 427 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TBXA2RP21731 343 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 F8A1P23610 371 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HTR1FP30939 366 aa6.41□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HCCSP53701 268 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MANEAQ5SRI9 462 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PTP4A1Q93096 173 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.41□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 EDARQ9UNE0 448 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SHISA3A0PJX4 238 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IRGMA1A4Y4 181 aa6.4□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 CSTAP01040 98 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RORAP35398 523 aa6.4□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 PSPHP78330 225 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF79Q15937 498 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RNLSQ5VYX0 342 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NIPAL3Q6P499 406 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TMEM65Q6PI78 240 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ARL9Q6T311 187 aa6.4□□□□□ -1.38
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HERC4-211ENST00000492996 OR4K13Q8NH42 304 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ST8SIA4Q92187 359 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CMAHPQ9Y471 501 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.4□□□□□ -1.38
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