RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1Q1	Q15612	314 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ETFDH	Q16134	617 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF613	Q6PF04	617 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf49	Q96BT1	292 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MUS81	Q96NY9	551 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB6	Q9NWX5	421 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ARID1A	O14497	2285 aa		15.25	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GWA3	101 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LIPT2	A6NK58	231 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPB7	O75200	414 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5H	O75947	161 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IMPDH2	P12268	514 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV1-2	P23083	117 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IDUA	P35475	653 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TGFBR3	Q03167	851 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	BNIP2	Q12982	314 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PPA1	Q15181	289 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CARM1	Q86X55	608 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF148	Q8N7C7	305 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXW5	Q969U6	566 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	EPYC	Q99645	322 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS50	Q9UI38	385 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		15.24	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	AQP7P3	A6NL99	342 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OVOL3	O00110	214 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PDLIM1	O00151	329 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GYG2	O15488	501 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2T1	O43869	369 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	AHSA1	O95433	338 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINA1	P01009	418 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	INHBB	P09529	407 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R41	P59536	307 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		Q5PR19	223 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CBLL1	Q75N03	491 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC38A4	Q969I6	547 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC13	Q9H3R2	512 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		15.23	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LYZL6	O75951	148 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	UBOX5	O94941	541 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNW1	P05000	195 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	DANCR	P0C864	163 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NCK1	P16333	377 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PTAFR	P25105	342 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR2A	P28223	471 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PTH2R	P49190	550 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IFI44L	Q53G44	452 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	DEF8	Q6ZN54	512 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RINL	Q6ZS11	566 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC103	Q8IW40	242 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MPP4	Q96JB8	637 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		15.22	■□□□□ 0.03

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