RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489388.5

CREM-240, Transcript of cAMP responsive element modulator, human

TSL 2

Gene CREM, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREM-240	ENST00000489388	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CREM-240	ENST00000489388	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CREM-240	ENST00000489388	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CREM-240	ENST00000489388		A0A1W2PR80	420 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	AGAP5	A6NIR3	686 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	SLC22A2	O15244	555 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	PGM3	O95394	542 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	PNP	P00491	289 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	IGHV1-2	P23083	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	PRTN3	P24158	256 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	P2RX1	P51575	399 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	SKP2	Q13309	424 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	RIN1	Q13671	783 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	NPAS1	Q99742	590 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	MED17	Q9NVC6	651 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	MOK	Q9UQ07	419 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	GMEB1	Q9Y692	573 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	IFNGR1	P15260	489 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	IL7R	P16871	459 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	GPX2	P18283	190 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	ADRA2C	P18825	462 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	KCNJ10	P78508	379 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	GNA13	Q14344	377 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	LEG1	Q6P5S2	330 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	RNF128	Q8TEB7	428 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	LRRC58	Q96CX6	371 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	RCN3	Q96D15	328 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388		A0A087WZY1	265 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	FXYD1	O00168	92 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	ADAMDEC1	O15204	470 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	COX4I1	P13073	169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	ZNF17	P17021	662 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	EDNRA	P25101	427 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	PGM1	P36871	562 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	CDK6	Q00534	326 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	HBM	Q6B0K9	141 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CREM-240	ENST00000489388	FKRP	Q9H9S5	495 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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