RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 UBQLN3Q9H347 655 aa8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 CMC2Q9NRP2 79 aa8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 NLKQ9UBE8 527 aa8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.78□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GVI7 797 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 C7orf66A4D0T2 115 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 CD8B2A6NJW9 211 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 C4orf47A7E2U8 309 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
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POLR1A-208ENST00000486964 PLPP2O43688 288 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ARL6IP5O75915 188 aa8.77□□□□□ -1.01
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POLR1A-208ENST00000486964 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 CD8BP10966 210 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF3P17036 446 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ACTA2P62736 377 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ACTG2P63267 376 aa8.77□□□□□ -1.01
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POLR1A-208ENST00000486964 P2RY14Q15391 338 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 BTBD16Q32M84 506 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 IDNKQ5T6J7 187 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 CD276Q5ZPR3 534 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ANKRD37Q7Z713 158 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 OAFQ86UD1 273 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 CPOQ8IVL8 374 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 COX18Q8N8Q8 333 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 OR14A16Q8NHC5 309 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 PHYHIPQ92561 330 aa8.77□□□□□ -1.01
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POLR1A-208ENST00000486964 OR2M2Q96R28 347 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF649Q9BS31 505 aa8.77□□□□□ -1.01
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POLR1A-208ENST00000486964 MED28Q9H204 178 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 OR52D1Q9H346 318 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 WDR54Q9H977 334 aa8.77□□□□□ -1.01
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POLR1A-208ENST00000486964 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 MCUBQ9NWR8 336 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.77□□□□□ -1.01
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POLR1A-208ENST00000486964 MALT1Q9UDY8 824 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.77□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.77□□□□□ -1.01
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POLR1A-208ENST00000486964 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.76□□□□□ -1.01
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POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 CDHR4A6H8M9 788 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 OR6C76A6NM76 312 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 IDSB3KWA1 339 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 BHLHE40O14503 412 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 SOCS6O14544 535 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ALOX12BO75342 701 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 RFPL3O75679 317 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 UBL3O95164 117 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 CH25HO95992 272 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ANXA3P12429 323 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 NID1P14543 1247 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 ELK1P19419 428 aa8.76□□□□□ -1.01
POLR1A-208ENST00000486964 C4BPBP20851 252 aa8.76□□□□□ -1.01
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