RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475593.5

TFRC-211, Transcript of transferrin receptor, humanhuman

TSL 3

Gene TFRC, Length 875 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFRC-211ENST00000475593 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 GALK2Q01415 458 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 TRAF3Q13114 568 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 CBFBQ13951 182 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SLC17A1Q14916 467 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 PPP1R7Q15435 360 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 KLHL26Q53HC5 615 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SLC25A53Q5H9E4 307 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 CASC10Q5T4H9 136 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 STEAP4Q687X5 459 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 NIPAL3Q6P499 406 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 Q6ZTK2 550 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 OLIG3Q7RTU3 272 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 TMEM99Q8N816 258 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 ICA1LQ8NDH6 482 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 FBXO36Q8NEA4 188 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 OR5W2Q8NH69 310 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 ZNF563Q8TA94 476 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 MS4A14Q96JA4 679 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 AMDHD1Q96NU7 426 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 TBX15Q96SF7 602 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 NMUR2Q9GZQ4 415 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 MIEF1Q9NQG6 463 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 NMRK1Q9NWW6 199 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 DCAF16Q9NXF7 216 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 FOXJ3Q9UPW0 622 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SIGLEC9Q9Y336 463 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 KCNE3Q9Y6H6 103 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 U3KQK5 164 aa4.96□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 LCE6AA0A183 80 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 AGAP5A6NIR3 686 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SYCE1LA8MT33 242 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SPRY3O43610 288 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 XPNPEP2O43895 674 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 OR4F21O95013 312 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 AKR7A3O95154 331 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 PLATP00750 562 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 IGHV4-59P01825 116 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 IGHMP01871 453 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 HLA-HP01893 362 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SFTPBP07988 381 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 UROSP10746 265 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 UBL4AP11441 157 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 IMPDH2P12268 514 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 DDCP20711 480 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 GLRXP35754 106 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 ARR3P36575 388 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 MAP3K8P41279 467 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 ERVS71-1P61550 626 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 TEKQ02763 1124 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 PAX8Q06710 450 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SPRNQ5BIV9 151 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 PDZK1Q5T2W1 519 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 LETMD1Q6P1Q0 360 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 PGBD2Q6P3X8 592 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 HMGN2P46Q86SG4 172 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 PDIK1LQ8N165 341 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 CDRT4Q8N9R6 151 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 OR9K2Q8NGE7 335 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 MGARPQ8TDB4 240 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 GIMAP5Q96F15 307 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 GPR22Q99680 433 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 BTBD2Q9BX70 525 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 LAT2Q9GZY6 243 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 MMP28Q9H239 520 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 ZNF385DQ9H6B1 395 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 BRF2Q9HAW0 419 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 TMEM181Q9P2C4 612 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 CHRNA9Q9UGM1 479 aa4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TFRC-211ENST00000475593 SNX6Q9UNH7 406 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms