RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4A15Q8NGL6 344 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 LITAFQ99732 161 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 WACQ9BTA9 647 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FAIM2Q9BWQ8 316 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NMUR2Q9GZQ4 415 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MYOZ2Q9NPC6 264 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAP2Q9NPF8 381 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 DYRK4Q9NR20 520 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 EFCAB7A8K855 629 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 KDELR3O43731 214 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 APOA1P02647 267 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 BIDP55957 195 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ERVK11-1P61568 191 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 TLE4Q04727 773 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 HSP90B2PQ58FF3 399 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 STUMQ69YW2 141 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FRA10AC1Q70Z53 315 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NRMQ8IXM6 262 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CMTM8Q8IZV2 173 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF248Q8NDW4 579 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM104Q8NE00 496 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 OR13C9Q8NGT0 318 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52E5Q8NH55 327 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF11Q92914 225 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ART5Q96L15 291 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 HSFY1Q96LI6 401 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A4EQ96PG1 132 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8B4Q96RC9 309 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ELOVL4Q9GZR5 314 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBP1Q9H171 429 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBB1Q9H4B7 451 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SENP1Q9P0U3 644 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NEURL4Q96JN8 1562 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM220BPB1ANY3 271 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 E9PQ18 207 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SOCS3O14543 225 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 DYNC1I1O14576 645 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SIVA1O15304 175 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FCN3O75636 299 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNB2O95067 398 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF1P05230 155 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 LAMP1P11279 417 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV1-2P23083 117 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXN2P32314 431 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 GCKP35557 465 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 PRELPP51888 382 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 PLK1P53350 603 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 LMO4P61968 165 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ERVK-25P63136 954 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL22Q53GT1 634 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM182AQ5T1J6 154 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF100Q8IYN0 542 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 JAGN1Q8N5M9 183 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC75AQ8NAA5 344 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPSLQ8WWF8 208 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ASZ1Q8WWH4 475 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO17Q96EF6 278 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 PAGE5Q96GU1 130 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 OPALINQ96PE5 141 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHDC3Q9BQ90 382 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 E9PAM4 449 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL21O00585 134 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CETN3O15182 167 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MBTPS2O43462 519 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SCELO95171 688 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 GJB5O95377 273 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MELTFP08582 738 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 GPM6AP51674 278 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 GPX6P59796 221 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 CDH17Q12864 832 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL6IP1Q15041 203 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A6Q4U2R8 563 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC23LQ6PF05 361 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ULK3Q6PHR2 472 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 GDPD3Q7L5L3 318 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 HDDC2Q7Z4H3 204 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-209ENST00000473406 SYCE1Q8N0S2 351 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms