RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466154.5

SLX4-202, Transcript of SLX4 structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLX4, Length 3,228 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4-202ENST00000466154 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 TRIM63Q969Q1 353 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PMEPA1Q969W9 287 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 FABP7O15540 132 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SCO2O43819 266 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 DOK2O60496 412 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SLC43A1O75387 559 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 TOXO94900 526 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 UTS2O95399 124 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 HIST1H2ABP04908 130 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 TACR3P29371 465 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 HTR2BP41595 481 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PPM1BO75688 479 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 ZFPL1O95159 310 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 FAM157BP0CG42 384 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SRMP19623 302 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SLC6A1P30531 599 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 BICRALQ6AI39 1079 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PXKQ7Z7A4 578 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.92□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PCDH15Q96QU1 1955 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 C2orf72A6NCS6 295 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 EFCAB7A8K855 629 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 RGS13O14921 159 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SSNA1O43805 119 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 FBXO45P0C2W1 286 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 MARCH3Q86UD3 253 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 ZNF527Q8NB42 609 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SYT4Q9H2B2 425 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 ICOSLGO75144 302 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 GALP22466 123 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 IL12BP29460 328 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 OR1D5P58170 312 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 BMPERQ8N8U9 685 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PRODH2Q9UF12 536 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.91□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 TCRBP04435 133 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 CD38P28907 300 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SNAPC3Q92966 411 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 WDR76Q9H967 626 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 RCE1Q9Y256 329 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 ZNF264O43296 627 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 BIKQ13323 160 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 NSDHLQ15738 373 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 LIPNQ5VXI9 398 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 YIPF5Q969M3 257 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 LPAR4Q99677 370 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.9□□□□□ -0.02
SLX4-202ENST00000466154 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms