RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ZBP1	Q9H171	429 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	PHF11	Q9UIL8	331 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378		E9PAM4	449 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC01565	O15544	149 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CXCL13	O43927	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	PRKY	O43930	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	OR10H3	O60404	316 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	UPK3A	O75631	287 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	FGF4	P08620	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF224	P0DH78	156 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ETS2	P15036	469 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	DPEP1	P16444	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	IDS	P22304	550 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ANXA13	P27216	316 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	HMGCL	P35914	325 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	PRKX	P51817	358 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	HSPA2	P54652	639 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CENPK	Q9BS16	269 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	PISD	Q9UG56	409 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	C5	P01031	1676 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378		A8MXQ7	604 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC17A2	O00624	439 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ZG16	O60844	167 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHG4	P01861	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CD1C	P29017	333 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	EPHX2	P34913	555 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ETV5	P41161	510 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CRYBB2	P43320	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	HMGCS2	P54868	508 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	MS4A2	Q01362	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CD300C	Q08708	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	IL18	Q14116	193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ITIH4	Q14624	930 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBBP4-208	ENST00000463378	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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