RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 GPR137Q96N19 417 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 UCK2Q9BZX2 261 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 NTN4Q9HB63 628 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 RASD1Q9Y272 281 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CACNA1CQ13936 2221 aa8.4□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 FAAHO00519 579 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TBX1O43435 398 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SERPINA3P01011 423 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CT45A8P0DMV1 189 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CT45A9P0DMV2 189 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 GNALP38405 381 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 C6orf52Q5T4I8 152 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 RFKQ969G6 155 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 MGAT4BQ9UQ53 548 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 A6NLC8 198 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZG16O60844 167 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 IRF2P14316 349 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PRKCAP17252 672 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 GPX2P18283 190 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 IGFBP5P24593 272 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TTC23Q5W5X9 447 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF613Q6PF04 617 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TRILQ7L0X0 811 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PRRC1Q96M27 445 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 C4orf51C9J302 202 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 C16orf97H3BN30 126 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ATE1O95260 518 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 GCGRP47871 477 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 BMXP51813 675 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TPTEP56180 551 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF117Q03924 483 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 PUDPQ08623 228 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 MOGQ16653 247 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ARSKQ6UWY0 536 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 KDM8Q8N371 416 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CITED4Q96RK1 184 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 DUSP13Q9UII6 198 aa8.39□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CLCA1A8K7I4 914 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 MT-ATP6P00846 226 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CRABP1P29762 137 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 NR4A2P43354 598 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 KIR2DL3P43628 341 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 SLC36A2Q495M3 483 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 CORO6Q6QEF8 472 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 MAVSQ7Z434 540 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 OR2T4Q8NH00 348 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ASB9Q96DX5 294 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 OR51B6Q9H340 312 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 M0R082 166 aa8.38□□□□□ -1.07
DDX39B-215ENST00000462256 RAD51DO75771 328 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms