RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461239.2

ECHDC1-212, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-212ENST00000461239 JTBO76095 146 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ANGPTL1O95841 491 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 HPNP05981 417 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 GUSBP08236 651 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 TFPTP0C1Z6 253 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 RNF224P0DH78 156 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 KRT20P35900 424 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 PLGLB1Q02325 96 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ESPL1Q14674 2120 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 RGNQ15493 299 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 EIPR1Q53HC9 387 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 PXKQ7Z7A4 578 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 GATSQ8NAP1 163 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SETD9Q8NE22 299 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 OR2M3Q8NG83 312 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ROPN1LQ96C74 230 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ARSGQ96EG1 525 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ZNF597Q96LX8 424 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 RMND5AQ9H871 391 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 MED11Q9P086 117 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 MKLN1Q9UL63 735 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 DNAJC13O75165 2243 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 A0A1W2PQD3 144 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 DUXAA6NLW8 204 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 CLDN24A6NM45 220 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 KIAA0513O60268 411 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 9.9
ECHDC1-212ENST00000461239 UGT2B17O75795 530 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 CBR3O75828 277 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 KRT34O76011 436 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 H6PDO95479 791 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ANP32DO95626 131 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 KRT16P08779 473 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 STSP08842 583 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 GPX2P18283 190 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 LCN1P31025 176 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 DCTP40126 519 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SOX2P48431 317 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 KHKP50053 298 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 GZMMP51124 257 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ATP12AP54707 1039 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 STX5Q13190 355 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SLC10A1Q14973 349 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ZNF141Q15928 474 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 C3AR1Q16581 482 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 DCST1Q5T197 706 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 CBLN3Q6UW01 205 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 GFRALQ6UXV0 394 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SNX32Q86XE0 403 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 GHDCQ8N2G8 530 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 MAL2Q969L2 176 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 CGREF1Q99674 301 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 DSN1Q9H410 356 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 UBQLN4Q9NRR5 601 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-212ENST00000461239 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms