RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 DOK1Q99704 481 aa22.85■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa22.85■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 FTCDNL1E5RQL4 147 aa22.84■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 RFXANKO14593 260 aa22.84■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 THBS4P35443 961 aa22.84■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 UGT2A3Q6UWM9 527 aa22.84■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF786Q8N393 782 aa22.84■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 LINC01356Q8N9X3 169 aa22.84■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 ARMC7Q9H6L4 198 aa22.84■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 LILRA1O75019 489 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 BCHEP06276 602 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 PNMTP11086 282 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF43P17038 809 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 APEX1P27695 318 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 MVDP53602 400 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 CLDN17P56750 224 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 STX3Q13277 289 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 SPATA21Q7Z572 469 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 SVOPLQ8N434 492 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 PNPOQ9NVS9 261 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF232Q9UNY5 417 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 GPR45Q9Y5Y3 372 aa22.83■■□□□ 1.25
PBRM1-218ENST00000458294 SDHDO14521 159 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF432O94892 652 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 CELA3BP08861 270 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 PRG2P13727 222 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 BGNP21810 368 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 IL2RGP31785 369 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 ARR3P36575 388 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 ARF1P84077 181 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 CLIP4Q8N3C7 705 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 IL17RDQ8NFM7 739 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 SLC38A5Q8WUX1 472 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 SLC25A36Q96CQ1 311 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 SPATA9Q9BWV2 254 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 DYNLRB1Q9NP97 96 aa22.82■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 SLC43A1O75387 559 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 ETFAP13804 333 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 SRP14P37108 136 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 CRATP43155 626 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 CDH15P55291 814 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 DSTNP60981 165 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 KRT71Q3SY84 523 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 SERPINA11Q86U17 422 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 KDM8Q8N371 416 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 UBASH3BQ8TF42 649 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 SNX18Q96RF0 628 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 PTDSS2Q9BVG9 487 aa22.81■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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PBRM1-218ENST00000458294 TMEM129A0AVI4 362 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 FZD7O75084 574 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 IL6P05231 212 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 ZCCHC18P0CG32 403 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 RIN1Q13671 783 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 ADRM1Q16186 407 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 ATG16L1Q676U5 607 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC36Q8IYA8 594 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 GPR137CQ8N3F9 429 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 CKAP2Q8WWK9 683 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 SLC35B4Q969S0 331 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf159Q96HA4 380 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 OXGR1Q96P68 337 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 GPR35Q9HC97 309 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 SLC6A13Q9NSD5 602 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 IFT52Q9Y366 437 aa22.8■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 IFNGR1P15260 489 aa22.79■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 PCMT1P22061 227 aa22.79■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 RPS5P46782 204 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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PBRM1-218ENST00000458294 CEACAM16Q2WEN9 425 aa22.79■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM19Q96HH6 336 aa22.79■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 TPT1P8Q9HAU6 139 aa22.79■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 B3GAT1Q9P2W7 334 aa22.79■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 USP22Q9UPT9 525 aa22.79■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM247A6NEH6 219 aa22.78■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 OR2T1O43869 369 aa22.78■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 ANP32DO95626 131 aa22.78■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PBRM1-218ENST00000458294 ITGA2P17301 1181 aa22.78■■□□□ 1.24
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