RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC28A2O43868 658 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2J2O76002 312 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV2-14P01704 120 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2T7P0C7T2 308 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC35E2P0CK97 266 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCKDHAP12694 445 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ICAM2P13598 275 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WNT5AP41221 380 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC18A1P54219 525 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZP1P60852 638 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PMP22Q01453 160 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL1RL1Q01638 556 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPRL3Q12980 569 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGFBP7Q16270 282 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NNATQ16517 81 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP78Q5JTW2 689 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL23RQ5VWK5 629 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPINK14Q6IE38 97 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM64Q6YI46 380 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM219AQ8IW50 185 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAGED4Q96JG8 741 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FCRL1Q96LA6 429 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF681Q96N22 645 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SFXN2Q96NB2 322 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CXorf21Q9HAI6 301 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLHL1Q9NR64 748 aa7.56□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 G3V3Y1 287 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SDHDO14521 159 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPM1O60762 260 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFAND5O76080 213 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR6B1O95007 311 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV3-11P04433 115 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SFTPCP11686 197 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DIO3P55073 304 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MLF1P58340 268 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLRB1Q12918 225 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR1C1Q15619 314 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTF1Q16619 201 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR27Q6MZM9 219 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM107Q6UX40 140 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSDL2Q6YN16 418 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCTD9Q7L273 389 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR22Q8IZ63 422 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC5A8Q8N695 610 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF611Q8N823 705 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MORN4Q8NDC4 146 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NSMAFQ92636 917 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPXQ9BT56 116 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYNNQ9NPC7 610 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCAP29Q9UHQ4 241 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ENTPD4Q9Y227 616 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.55□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0G2JMM0 328 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PPB8 328 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PRS3 328 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5H15A6NDH6 313 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B8ZZF3 427 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WISP2O76076 250 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAMP1P11279 417 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S1PR1P21453 382 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RFC3P40938 356 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOX3P41225 446 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC9A3P48764 834 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNFSF10P50591 281 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.54□□□□□ -1.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.54□□□□□ -1.2
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