RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 TAS2R5Q9NYW4 299 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 GTF3C1Q12789 2109 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ESPL1Q14674 2120 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CD8B2A6NJW9 211 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF716A6NP11 495 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CCL21O00585 134 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PLPP3O14495 311 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CXCL13O43927 109 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CYTIPO60759 359 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 RAMP1O60894 148 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SYNGR4O95473 234 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHMP01871 453 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 OPN1LWP04000 364 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 STSP08842 583 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 TFPIP10646 304 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 OSMP13725 252 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ACVR2AP27037 513 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CA7P43166 264 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 UQCRFS1P47985 274 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PDK3Q15120 406 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 OR7A5Q15622 319 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 C3AR1Q16581 482 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 RFX4Q33E94 735 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBED5Q49AG3 693 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 GXYLT1Q4G148 440 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 HBMQ6B0K9 141 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 RTL6Q6ICC9 239 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM122BQ7Z309 247 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 FANK1Q8TC84 345 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 OSTF1Q92882 214 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 MBOAT4Q96T53 435 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PITX2Q99697 317 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 GP6Q9HCN6 339 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 TINAGQ9UJW2 476 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ZAR1LA6NP61 321 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CLCA1A8K7I4 914 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 E9PLN8 166 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 MS4A18H0YCH9 400 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 BHLHE40O14503 412 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ARPC3O15145 178 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 AQP8O94778 261 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 AKR7A3O95154 331 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 VAMP5O95183 116 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 TXNDC12O95881 172 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 FCGR2AP12318 317 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ENPP1P22413 925 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 EPHA2P29317 976 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 AQP2P41181 271 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SMSP52788 366 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CARD18P57730 90 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PRPS1P60891 318 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 ESRRGP62508 458 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PUDPQ08623 228 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC17A1Q14916 467 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SNCBQ16143 134 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC36A3Q495N2 470 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 RRM2BQ7LG56 351 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 PXKQ7Z7A4 578 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 OAFQ86UD1 273 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 FJX1Q86VR8 437 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 CDK20Q8IZL9 346 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM99Q8N816 258 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-207ENST00000454947 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms