RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	CCKAR	P32238	428 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	RASSF2	P50749	326 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	LTB	Q06643	244 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	PUDP	Q08623	228 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ZP4	Q12836	540 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ITGAD	Q13349	1161 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	TRAM2	Q15035	370 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	CASP12	Q6UXS9	341 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	PXK	Q7Z7A4	578 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	GPAT4	Q86UL3	456 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ASB9	Q96DX5	294 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	PYURF	Q96I23	114 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	C7orf34	Q96L11	122 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	MED31	Q9Y3C7	131 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PRQ8	180 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	PLPP3	O14495	311 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	SEMG1	P04279	462 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2AB	P04908	130 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM11A	P58511	58 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	BNIP1	Q12981	228 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	PMS2P3	Q13401	168 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	DGCR6	Q14129	220 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	LCN8	Q6JVE9	175 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	AAED1	Q7RTV5	226 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	DHFR2	Q86XF0	187 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	P3H2	Q8IVL5	708 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	MED18	Q9BUE0	208 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ASB6	Q9NWX5	421 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241		A6NNC1	897 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A18	H0YCH9	400 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	PDLIM1	O00151	329 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	FFAR1	O14842	300 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	CASK	O14936	926 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	GYG2	O15488	501 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF432	O94892	652 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	STAMBP	O95630	424 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	CH25H	O95992	272 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ADA	P00813	363 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	NTF4	P34130	210 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	UGT2B15	P54855	530 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	TGFBR3	Q03167	851 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	TLE4	Q04727	773 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	UEVLD	Q8IX04	471 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	SGTB	Q96EQ0	304 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	BOD1	Q96IK1	185 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	PIP5K1A	Q99755	562 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS50	Q9UI38	385 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	ENO4	A6NNW6	628 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	OR7A10	O76100	309 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PTPA-222	ENST00000445241	OR6A2	O95222	327 aa		12.92	□□□□□ -0.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms