RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SSX8Q7RTT4 187 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 KDM8Q8N371 416 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5J2Q8NH18 312 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM239Q8WW34 195 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ASB6Q9NWX5 421 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 RCE1Q9Y256 329 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX13Q9Y5W8 968 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRN3E7EW58 273 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PDLIM1O00151 329 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PLPP3O14495 311 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CH25HO95992 272 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CBLP22681 906 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 IL32P24001 234 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ZP4Q12836 540 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 RINLQ6ZS11 566 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PXKQ7Z7A4 578 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 LIPHQ8WWY8 451 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 HSD17B8Q92506 261 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 S100PBPQ96BU1 408 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PYURFQ96I23 114 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 LURAP1Q96LR2 239 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NANSQ9NR45 359 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 UPB1Q9UBR1 384 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MED31Q9Y3C7 131 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 FFAR1O14842 300 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF432O94892 652 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PRSS23O95084 383 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV3-9P01782 118 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 HRGP04196 525 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 THBDP07204 575 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT2B15P54855 530 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP10-9P60411 292 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PUDPQ08623 228 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 FAPQ12884 760 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAM2Q15035 370 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP4Z1Q86W10 505 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 UEVLDQ8IX04 471 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 C7orf34Q96L11 122 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MUS81Q96NY9 551 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CENPEQ02224 2701 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ENO4A6NNW6 628 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 J3KTA2 159 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ARPC2O15144 300 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 OR6A2O95222 327 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 HPRP00739 348 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H2ABP04908 130 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 RHCEP18577 417 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PTNP21246 168 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MPGP29372 298 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 CLDN17P56750 224 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGEF1-204ENST00000442563 SGTBQ96EQ0 304 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms