RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 CSTAP01040 98 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 HPNP05981 417 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SOD3P08294 240 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 GKN3PP0CG01 181 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF23P17027 643 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 HMGA2P52926 109 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CDH12P55289 794 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 HOXC5Q00444 222 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF117Q03924 483 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 EPS8Q12929 822 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 VWA1Q6PCB0 445 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CBR4Q8N4T8 237 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 GATSQ8NAP1 163 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 EME1Q96AY2 570 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 STARD4Q96DR4 205 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 NRBF2Q96F24 287 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 MCHR1Q99705 422 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TM9SF2Q99805 663 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SLC29A1Q99808 456 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PRR14Q9BWN1 585 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 C8orf4Q9NR00 106 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 USE1Q9NZ43 259 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 U3KQV3 271 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 A0A0B4J2E0 115 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1B0GX12 115 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1W2PNV4 684 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1W2PRQ8 180 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SLC35F4A4IF30 521 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TNFRSF11BO00300 401 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 FAAHO00519 579 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 DLGAP1O14490 977 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 GNGT2O14610 69 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF264O43296 627 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 SCO2O43819 266 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 E2F6O75461 281 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 GADD45GO95257 159 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ANGPTL1O95841 491 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ALPLP05186 524 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 H1F0P07305 194 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 HPGDP15428 266 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 HNF1AP20823 631 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 DPP4P27487 766 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PCYT1AP49585 367 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 AQP4P55087 323 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ACTG1P63261 375 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 DAG1Q14118 895 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 DGCR6Q14129 220 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 LAPTM4AQ15012 233 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PRR31Q5SQ13 230 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 BICRALQ6AI39 1079 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 FAHD1Q6P587 224 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 CBLN3Q6UW01 205 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 MARCH3Q86UD3 253 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 MISPQ8IVT2 679 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TMCO6Q96DC7 493 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF597Q96LX8 424 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 GNRHR2Q96P88 292 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-211ENST00000429899 LAT2Q9GZY6 243 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms