RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	EVPLL	A8MZ36	301 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2T1	O43869	369 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF432	O94892	652 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM157C	P0CG43	387 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PTN	P21246	168 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPS1	P60891	318 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	LGALS3BP	Q08380	585 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF544	Q6NX49	715 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KDM8	Q8N371	416 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DPP10	Q8N608	796 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		15.49	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TPST2	O60704	377 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	UPK3A	O75631	287 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MFN2	O95140	757 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	WNT11	O96014	354 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC6A2	P23975	617 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NRF1	Q16656	503 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NIPAL3	Q6P499	406 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ULK3	Q6PHR2	472 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RETREG3	Q86VR2	466 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PTOV1	Q86YD1	416 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MUC15	Q8N387	334 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	HIPK4	Q8NE63	616 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC38A4	Q969I6	547 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TAAR8	Q969N4	342 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF607	Q96SK3	696 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NELFA	Q9H3P2	528 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RCE1	Q9Y256	329 aa		15.48	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0B4J2E0	115 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GX12	115 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	AIM2	O14862	343 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	LGI1	O95970	557 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PAX7	P23759	505 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6S1	Q8NH40	331 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	OXGR1	Q96P68	337 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CGREF1	Q99674	301 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR14	Q9BWN1	585 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	FKRP	Q9H9S5	495 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		15.47	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087WUJ7	227 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R082	166 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	GPRIN2	O60269	458 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINB7	O75635	380 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT33A	O76009	404 aa		15.46	■□□□□ 0.07
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF43	P17038	809 aa		15.46	■□□□□ 0.07

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