RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC6AQ6EIG7 209 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 OR2A2Q6IF42 318 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NANOGP8Q6NSW7 305 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ADAM5Q6NVV9 412 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SBSNQ6UWP8 590 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 HSDL2Q6YN16 418 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CHMP1BQ7LBR1 199 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SVOPLQ8N434 492 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 OR5L2Q8NGL0 311 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 OR13C4Q8NGS5 318 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 AGR3Q8TD06 166 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NCLNQ969V3 563 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NRBF2Q96F24 287 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 FOPNLQ96NB1 174 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GPR21Q99679 349 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SLC29A1Q99808 456 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NANOGQ9H9S0 305 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NGBQ9NPG2 151 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GALPQ9UBC7 116 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SLC6A5Q9Y345 797 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RNF115Q9Y4L5 304 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SUPT3HB4E1H0 165 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 LSM1O15116 133 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ARPC2O15144 300 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 P2RX6O15547 441 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SUPT3HO75486 399 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GMNNO75496 209 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CRCPO75575 148 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFB8O95169 186 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CRHP06850 196 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00032P0C843 101 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 DANCRP0C864 163 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 MPC1LP0DKB6 136 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CCL3P10147 92 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GGT1P19440 569 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6V1B2P21281 511 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRK-211ENST00000429595 GALNSP34059 522 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CAPGP40121 348 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ALDH3A2P51648 485 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRK-211ENST00000429595 FOXA1P55317 472 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRK-211ENST00000429595 CXCR4P61073 352 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 BTG2P78543 158 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RELAQ04206 551 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GK3PQ14409 553 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GBX1Q14549 363 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TSNQ15631 228 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TTLL9Q3SXZ7 439 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 AGAP6Q5VW22 663 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 KRT80Q6KB66 452 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 SATL1Q86VE3 508 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CALHM3Q86XJ0 350 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 DDIASQ8IXT1 998 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC22A15Q8IZD6 547 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF525Q8N782 197 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 APCDD1LQ8NCL9 501 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 METTL6Q8TCB7 284 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 VPS33AQ96AX1 596 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 TESCQ96BS2 214 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 FCRL1Q96LA6 429 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF583Q96ND8 569 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 ZBTB18Q99592 522 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 CGREF1Q99674 301 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRK-211ENST00000429595 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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