RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 MST1LQ2TV78 715 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD16Q6P6B7 361 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 LINGO2Q7L985 606 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 NELFAQ9H3P2 528 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 TCF7L2Q9NQB0 619 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ATRQ13535 2644 aa18.29■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 MXRA5Q9NR99 2828 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf58C9J3I9 102 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 UPK3AO75631 287 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 IFNA2P01563 188 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV3-15P01624 115 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV1-44P01699 117 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 CRYAAP02489 173 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF43P17038 809 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 RPS5P46782 204 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 LGALS3BPQ08380 585 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 FAM69AQ5T7M9 428 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 MSRB3Q8IXL7 192 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 HTRA1Q92743 480 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SLC38A4Q969I6 547 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 KCNS3Q9BQ31 491 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 CA10Q9NS85 328 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 B3GAT1Q9P2W7 334 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 FKBP7Q9Y680 259 aa18.28■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFS8O00217 210 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 AIM2O14862 343 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 HOXC5Q00444 222 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 CHRFAM7AQ494W8 412 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 GCNT6Q5T4J0 391 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 FAM91A1Q658Y4 838 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 HMBOX1Q6NT76 420 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 FUNDC1Q8IVP5 155 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A36Q96CQ1 311 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 OXGR1Q96P68 337 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC28BQ9BUN5 200 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM38AQ9H6F2 299 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
LIMS1-208ENST00000428064 COL6A5A8TX70 2615 aa18.27■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SVEP1Q4LDE5 3571 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SLC43A1O75387 559 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN17P56750 224 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 NAAAQ02083 359 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 EFNB3Q15768 340 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 AGBL2Q5U5Z8 902 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 REEP3Q6NUK4 255 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 KRT73Q86Y46 540 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 OR6S1Q8NH40 331 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SPDL1Q96EA4 605 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO17Q96EF6 278 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 EVA1AQ9H8M9 152 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CORO2BQ9UQ03 480 aa18.26■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GWA3 101 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 VWC2LB2RUY7 222 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 B9A039 149 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CECR9P0C854 216 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 HTR2AP28223 471 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINF1P36955 418 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 IDH3AP50213 366 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CDK6Q00534 326 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD13AQ14CX5 517 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ALG10BQ5I7T1 473 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 ULK3Q6PHR2 472 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf111Q8N326 155 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 KDM8Q8N371 416 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 NUP37Q8NFH4 326 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 OR4F15Q8NGB8 312 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 NFKBIDQ8NI38 313 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 TAAR8Q969N4 342 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 SORCS2Q96PQ0 1159 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC167Q9P0B6 97 aa18.25■□□□□ 0.51
LIMS1-208ENST00000428064 VAPAQ9P0L0 249 aa18.25■□□□□ 0.51
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