RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFPTP0C1Z6 253 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THBS4P35443 961 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL14P50914 215 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH15P55291 814 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK11Q15759 364 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF220Q5VTB9 566 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF621Q6ZSS3 439 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA21Q7Z572 469 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF786Q8N393 782 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52P1PQ8NH57 321 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX18Q96RF0 628 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SORT1Q99523 831 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOK1Q99704 481 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RX2Q9UBL9 471 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11.4□□□□□ -0.58
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VSTM5A8MXK1 200 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM229AB2RXF0 380 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AHSA1O95433 338 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT75O95678 551 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNMTP11086 282 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBR1P16152 277 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UFM1P61960 85 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC74AQ0VAA2 488 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIP10Q15642 601 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OGFOD2Q6N063 350 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK35Q8TDR2 534 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52E6Q96RD3 313 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEAF6Q9HAF1 191 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AIG1Q9NVV5 245 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAO1Q9UJM8 370 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RCE1Q9Y256 329 aa11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM129A0AVI4 362 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIRC5O15392 142 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF432O94892 652 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCHEP06276 602 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRG2P13727 222 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNGR1P15260 489 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF43P17038 809 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL12AP29459 219 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARR3P36575 388 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC1A6P48664 564 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRISP3P54108 245 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN17P56750 224 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARF1P84077 181 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPRL3Q12980 569 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIN1Q13671 783 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADRM1Q16186 407 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RINLQ6ZS11 566 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK20Q8IZL9 346 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM8Q8N371 416 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTDSS2Q9BVG9 487 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOX3Q9HBY0 568 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALML5Q9NZT1 146 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC43A1O75387 559 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCMT1P22061 227 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MVDP53602 400 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNIQ14094 377 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG16L1Q676U5 607 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT2A3Q6UWM9 527 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINA11Q86U17 422 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLIP4Q8N3C7 705 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A36Q96CQ1 311 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPK1Q9H3S4 243 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR35Q9HC97 309 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GAT1Q9P2W7 334 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST2Q9Y4C5 530 aa11.38□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFXANKO14593 260 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FZD7O75084 574 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SASH3O75995 380 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADRA2AP08913 450 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETFAP13804 333 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BGNP21810 368 aa11.37□□□□□ -0.59
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRATP43155 626 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms