RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTR6Q9GZN1 396 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 HRASLSQ9HDD0 168 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 GLTPQ9NZD2 209 aa17.08■□□□□ 0.33
SH3BP1-202ENST00000417536 NCOR1O75376 2440 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 C4orf47A7E2U8 309 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CTDSPLO15194 276 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 MPC2O95563 127 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PTHLHP12272 177 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 VEGFCP49767 419 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CCR9P51686 369 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SNTA1Q13424 505 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NXPE2Q96DL1 559 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 KLK11Q9UBX7 282 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35E2P0CK97 266 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SRFP11831 508 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDT1P36639 197 aa17.07■□□□□ 0.32
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SH3BP1-202ENST00000417536 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZTK2 550 aa17.07■□□□□ 0.32
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SH3BP1-202ENST00000417536 SPACA7Q96KW9 195 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CHIAQ9BZP6 476 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa17.07■□□□□ 0.32
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SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf74A8MZ97 194 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 S1PR1P21453 382 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 STPG1Q5TH74 334 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa17.07■□□□□ 0.32
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SH3BP1-202ENST00000417536 PRR32B1ATL7 298 aa17.07■□□□□ 0.32
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SH3BP1-202ENST00000417536 NLRC3Q7RTR2 1065 aa17.07■□□□□ 0.32
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SH3BP1-202ENST00000417536 TSTD1Q8NFU3 115 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NARFLQ9H6Q4 476 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LIN7BQ9HAP6 207 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CIB4A0PJX0 185 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2W5A6NFC9 320 aa17.06■□□□□ 0.32
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SH3BP1-202ENST00000417536 RAB38P57729 211 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FAAP20Q6NZ36 180 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF550Q7Z398 422 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC43A2Q8N370 569 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RSC1A1Q92681 617 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 MFRPQ9BY79 579 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LRIT1Q9P2V4 623 aa17.06■□□□□ 0.32
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SH3BP1-202ENST00000417536 THEGLP0DJG4 465 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF44Q7L0R7 432 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RIT1Q92963 219 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LRFN5Q96NI6 719 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 TSSK2Q96PF2 358 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SCML1Q9UN30 329 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF281Q9Y2X9 895 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0J9YY10 115 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 GPRIN2O60269 458 aa17.05■□□□□ 0.32
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SH3BP1-202ENST00000417536 TYRP1P17643 537 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 DPP4P27487 766 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR143P51810 404 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 PGDP52209 483 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 BLVRAP53004 296 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 STX4Q12846 297 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 APOOLQ6UXV4 268 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 NPSR1Q6W5P4 371 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SIX5Q8N196 739 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FTMTQ8N4E7 242 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF511Q8NB15 262 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-CQ95604 372 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 TWSG1Q9GZX9 223 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM60AQ9NP50 221 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 CPNE7Q9UBL6 633 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF215Q9Y6U7 377 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 MPDZO75970 2070 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 G3V3Q6 166 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 TGFBR3LH3BV60 316 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 I3L521 148 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 SCO1O75880 301 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT33AO76009 404 aa17.05■□□□□ 0.32
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