RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382911.8

C18orf54-202, Transcript of chromosome 18 open reading frame 54, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene C18orf54, Length 4,056 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf54-202ENST00000382911 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 FBP2O00757 339 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SPOPO43791 374 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 FCN3O75636 299 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 KCNH1O95259 989 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 IGHV3-9P01782 118 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 OPN1LWP04000 364 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 GPIP06744 558 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 TUBG1P23258 451 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 HSPA7P48741 367 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 STX5Q13190 355 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 KRT72Q14CN4 511 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 LGALS9CQ6DKI2 356 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 CBLN3Q6UW01 205 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 RNF175Q8N4F7 328 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 Q8TCH9 128 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 LRRC39Q96DD0 335 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 VPS11Q9H270 941 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 NUDT4Q9NZJ9 180 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa3.3□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 CHST1O43916 411 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 NPIPB7O75200 414 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 VAMP5O95183 116 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SERPINA5P05154 406 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 APRTP07741 180 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 FBP1P09467 338 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ACP2P11117 423 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 BCKDHAP12694 445 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 RWDD2BP57060 319 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 CCL8P80075 99 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 PLAURQ03405 335 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 LAPTM4AQ15012 233 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 QPRTQ15274 297 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SPRNQ5BIV9 151 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 RNF130Q86XS8 419 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 KLHL29Q96CT2 875 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 PITX2Q99697 317 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 GPR35Q9HC97 309 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 DUSP22Q9NRW4 184 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 B3GAT1Q9P2W7 334 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SULT2B1O00204 365 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 NR5A2O00482 541 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SLC43A1O75387 559 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 CLPTM1O96005 669 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 HSD3B1P14060 373 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 CD1DP15813 335 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 TSPAN8P19075 237 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 HSD3B2P26439 372 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 MYCNOSP40205 109 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 CENPAP49450 140 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 THBS3P49746 956 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 CBFBQ13951 182 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 TSNQ15631 228 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 KRT80Q6KB66 452 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 COMMD6Q7Z4G1 85 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SLC7A13Q8TCU3 470 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 DDOQ99489 341 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 GATA4P43694 442 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ATP6V0D1P61421 351 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 OR4D1Q15615 310 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 MECRQ9BV79 373 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 FAIM2Q9BWQ8 316 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 ANKRA2Q9H9E1 313 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 UPK3AO75631 287 aa3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
C18orf54-202ENST00000382911 SERPINB4P48594 390 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms