RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 ZNF404Q494X3 552 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CCDC157Q569K6 752 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 FADS6Q8N9I5 356 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ASB15Q8WXK1 588 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 Q96M85 177 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 NMNAT3Q96T66 252 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-202ENST00000338546 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 OR6C68A6NDL8 312 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 METTL15A6NJ78 407 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 IGHMP01871 453 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 IDUAP35475 653 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CENPAP49450 140 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ENTPD1P49961 510 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 BMXP51813 675 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 EXD3Q8N9H8 876 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 OR2M3Q8NG83 312 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SGCZQ96LD1 299 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 HMG20AQ9NP66 347 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 INIPQ9NRY2 104 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 OR6A2O95222 327 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RENP00797 406 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 HLA-DPB1P04440 258 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CLUP10909 449 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 GRPRP30550 384 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ACTA2P62736 377 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ACTG2P63267 376 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZNF846Q147U1 533 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TRAM1Q15629 374 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 GXYLT1Q4G148 440 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 LEG1Q6P5S2 330 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SYS1Q8N2H4 156 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TMEM99Q8N816 258 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 OR2T4Q8NH00 348 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 MCFD2Q8NI22 146 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 RASD2Q96D21 266 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 MNTQ99583 582 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TIMP4Q99727 224 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PRRX2Q99811 253 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 MED18Q9BUE0 208 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 B4DXG7 233 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CLDN25C9JDP6 229 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 PLPP3O14495 311 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SERPINA7P05543 415 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 DNASE1L3Q13609 305 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 BICRALQ6AI39 1079 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ARSKQ6UWY0 536 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 FANCFQ9NPI8 374 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-202ENST00000338546 CACNA1HO95180 2353 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms