RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322344.7

PNKP-201, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PNKP, Length 2,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-201ENST00000322344 AGRPO00253 132 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 CTDSPLO15194 276 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 OR2B3O76000 313 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 DHFRP00374 187 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 GZMKP49863 264 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 MAB21L1Q13394 359 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 SLC36A2Q495M3 483 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 CBLN3Q6UW01 205 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 TTLL10Q6ZVT0 673 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 DEFB119Q8N690 84 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ZNF321PQ8N8H1 164 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 YIPF5Q969M3 257 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 MOGAT1Q96PD6 335 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 OR8D2Q9GZM6 311 aa20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 CENPBD1B2RD01 187 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 IGKV3-11P04433 115 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 SRMP19623 302 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 FAPQ12884 760 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 UBE2NLQ5JXB2 153 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 APOOLQ6UXV4 268 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 KRT74Q7RTS7 529 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ZNF563Q8TA94 476 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ZFAND1Q8TCF1 268 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 NOX4Q9NPH5 578 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 MCUBQ9NWR8 336 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 COPZ2Q9P299 210 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 SERPINI2O75830 405 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 MAOBP27338 520 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 BTCP35070 178 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 EGR4Q05215 589 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ADIPOR1Q96A54 375 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 MNTQ99583 582 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ADAM19Q9H013 955 aa20.36■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 H3BMH7 237 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 MST1P26927 711 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 EFR3AQ14156 821 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 GPR139Q6DWJ6 353 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 SYT9Q86SS6 491 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 PLCZ1Q86YW0 608 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ZNF721Q8TF20 911 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 LPAR4Q99677 370 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 MRI1Q9BV20 369 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 FKRPQ9H9S5 495 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 BOLA1Q9Y3E2 137 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.35■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 A0A1B0GVT2 93 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 A8MUA0 341 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 SCO2O43819 266 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ITGA10O75578 1167 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 DDAH2O95865 285 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 HIST1H2ABP04908 130 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 TACR3P29371 465 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 OR1D4P47884 311 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 LTBQ06643 244 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 OR2T4Q8NH00 348 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 TSLPQ969D9 159 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ADOQ96SZ5 270 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 GON7Q9BXV9 100 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 PLSCR3Q9NRY6 295 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 PIN1P1O15428 100 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ARL4DP49703 201 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 HSD11B2P80365 405 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 TNK1Q13470 666 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 TDGQ13569 410 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 NKAIN2Q5VXU1 208 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 LYPD4Q6UWN0 246 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 LGALS14Q8TCE9 139 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 CLEC4AQ9UMR7 237 aa20.34■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.33■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 A0A0B4J203 849 aa20.33■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 C7orf66A4D0T2 115 aa20.33■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 AIPO00170 330 aa20.33■□□□□ 0.85
PNKP-201ENST00000322344 ARHGEF9O43307 516 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms