RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 CRLF2Q9HC73 371 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 BCL2L10Q9HD36 194 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 PTGFRNQ9P2B2 879 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 ARPC5O15511 151 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 DUX1O43812 170 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SPI1P17947 270 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 FPR1P21462 350 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 PPP2R1BP30154 601 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 CNR2P34972 360 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 DUSP2Q05923 314 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 ECH1Q13011 328 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 IFI44LQ53G44 452 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SSX6Q7RTT6 188 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 PLXDC1Q8IUK5 500 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 CMIPQ8IY22 773 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SLC35F3Q8IY50 421 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 HSD17B8Q92506 261 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 OR51I1Q9H343 314 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 HCRTR1O43613 425 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 ATP1B1P05026 303 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 MST1P26927 711 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 GGT2P36268 569 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 NCF4Q15080 339 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 KMT5CQ86Y97 462 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SLC43A2Q8N370 569 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 OR52J3Q8NH60 311 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SLC25A28Q96A46 364 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM41AQ96HV5 264 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 TGM7Q96PF1 710 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 KATNB1Q9BVA0 655 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SUCNR1Q9BXA5 334 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 ARL6Q9H0F7 186 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 TREM2Q9NZC2 230 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 CHST2Q9Y4C5 530 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1B0GVI7 797 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 HYKKA2RU49 373 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 C5orf52A6NGY3 159 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 NSA2O95478 260 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 GPR75O95800 540 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 AGR2O95994 175 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 TFP02787 698 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SCG5P05408 212 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 TFPIP10646 304 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 CPMP14384 443 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 RAB5BP61020 215 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SQSTM1Q13501 440 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 RNF212Q495C1 297 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 OR2L13Q8N349 312 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 BBS10Q8TAM1 723 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM19Q96HH6 336 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 TPD52L3Q96J77 140 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF607Q96SK3 696 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 EPYCQ99645 322 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM74BQ9NUR3 256 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SPAG17Q6Q759 2223 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 A0A087WV62 115 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 C1orf196B1AJZ1 125 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 CSO75390 466 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SULT1A3P0DMM9 295 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 SULT1A4P0DMN0 295 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 ALPPL2P10696 532 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 NQO2P16083 231 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 AQP1P29972 269 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 GINS1Q14691 196 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF750Q32MQ0 723 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 HSDL2Q6YN16 418 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 PRSS41Q7RTY9 318 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF383Q8NA42 475 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 NUP43Q8NFH3 380 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 OR9A2Q8NGT5 310 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 OR10K1Q8NGX5 313 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 GAREM1Q9H706 876 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 RLIMQ9NVW2 624 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 ADAMDEC1O15204 470 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 RAD1O60671 282 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 TCRBP04435 133 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 C8orf89P0DMQ9 161 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 BTCP35070 178 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 GPR143P51810 404 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 GFERP55789 205 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 RPS26P62854 115 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXA3-201ENST00000317201 S100PBPQ96BU1 408 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms