RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 J3KTA2 159 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 FABP7O15540 132 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ITGA10O75578 1167 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 UPK3AO75631 287 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 AP2A2O94973 939 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 RRASP10301 218 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 IFI30P13284 250 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 LHCGRP22888 699 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 S100PP25815 95 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 DPP4P27487 766 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 CNR2P34972 360 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 TPBGQ13641 420 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 TMEM65Q6PI78 240 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SSX9Q7RTT3 188 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 IGSF8Q969P0 613 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 UPRTQ96BW1 309 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SGTBQ96EQ0 304 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 CIPCQ9C0C6 399 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 TMEM82A0PJX8 343 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 IRGMA1A4Y4 181 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 C7orf66A4D0T2 115 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 FITM1A5D6W6 292 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 M0QZK8 103 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 M0QZQ0 153 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 MMP20O60882 483 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ENTPD6O75354 484 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 GADD45GO95257 159 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ADAP00813 363 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 OR56A5P0C7T3 313 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 HLA-EP13747 358 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SOX3P41225 446 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 GDF5P43026 501 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 XCR1P46094 333 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 MMP15P51511 669 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 CDH12P55289 794 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 RBPJQ06330 500 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 UPP1Q16831 310 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 GALNT10Q86SR1 603 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SYT12Q8IV01 421 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SMPDL3AQ92484 453 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ZFP42Q96MM3 310 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 CD180Q99467 661 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.39□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 PLXNA3P51805 1871 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 C2orf78A6NCI8 922 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 A8MUA0 341 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SERPINE3A8MV23 424 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 OGG1O15527 345 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 GMDSO60547 372 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SLC19A2O60779 497 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 BRI3O95415 125 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 PRAMEF1O95521 474 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ZNF44P15621 663 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 ITGA3P26006 1051 aa8.38□□□□□ -1.07
MMP3-201ENST00000299855 SLC6A1P30531 599 aa8.38□□□□□ -1.07
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