RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 TMPPEQ6ZT21 453 aa18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa18.63■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 AKR7A3O95154 331 aa18.6■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 SLC6A15Q9H2J7 730 aa18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 GRHPRQ9UBQ7 328 aa18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL21Q9UJP4 597 aa18.6■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 SEC14L5O43304 696 aa18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF24P17028 368 aa18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 SDHAP31040 664 aa18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 NUDT6P53370 316 aa18.6■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 EXTL1Q92935 676 aa18.6■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa18.6■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0J9YW62 118 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 SNTNA6NMZ2 147 aa18.59■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 IMPA2O14732 288 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFSF11O14788 317 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 TFECO14948 347 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGB2P05107 769 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 EMC4Q5J8M3 183 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 RNFT1Q5M7Z0 435 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR139Q6DWJ6 353 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 Q6ZS92 163 aa18.59■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF540Q8NDQ6 660 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKK1Q8NFD2 765 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 OR52E2Q8NGJ4 325 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 OR4K13Q8NH42 304 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 AMBNQ9NP70 447 aa18.59■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PNV4 684 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 PTGES3LE9PB15 166 aa18.58■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 SERPINI2O75830 405 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 TXNDC12O95881 172 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 PLGP00747 810 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 PAICSP22234 425 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 STARP49675 285 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 NXNL2Q5VZ03 156 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 CPOQ8IVL8 374 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 UBQLNLQ8IYU4 475 aa18.58■□□□□ 0.57
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