RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 C4orf36Q96KX1 117 aa20.59■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 SH3GL3Q99963 347 aa20.59■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 BARHL1Q9BZE3 327 aa20.59■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 SNTG1Q9NSN8 517 aa20.59■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 A3GALT2U3KPV4 340 aa20.59■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 E9PI62 339 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 H7C1C5 153 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 TCN2P20062 427 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 LCN6P62502 163 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 ACTC1P68032 377 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 ACTA1P68133 377 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 MXD1Q05195 221 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 FOXF1Q12946 379 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 LCN1P1Q5VSP4 162 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 M1APQ8TC57 530 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 STK35Q8TDR2 534 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 TAAR9Q96RI9 348 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 KMT2EQ8IZD2 1858 aa20.58■□□□□ 0.89
VSTM4-201ENST00000298454 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 J3QLW9 94 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SELENOFO60613 162 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 CDRT1O95170 752 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF19P17023 458 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 GRPRP30550 384 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 PYCR1P32322 319 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 OR12D2P58182 307 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 INSL4Q14641 139 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SGCBQ16585 318 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35D3Q5M8T2 416 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 IL20RBQ6UXL0 311 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SYT14Q8NB59 555 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 OR5J2Q8NH18 312 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 HDHD5Q9BXW7 423 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 TPK1Q9H3S4 243 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 AHSA1O95433 338 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 MT-ND5P03915 603 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 IL11P20809 199 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 AHCYP23526 432 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 TGM4P49221 684 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 BDH1Q02338 343 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SPEM2Q0P670 501 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 EMC4Q5J8M3 183 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 LINC01590Q5TEZ4 76 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFAF7Q7L592 441 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 POMGNT2Q8NAT1 580 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM9BQ9NQ34 198 aa20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 C9orf172C9J069 976 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 PLGP00747 810 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 E2F1Q01094 437 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SLC6A19Q695T7 634 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35F2Q8IXU6 374 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 EXD3Q8N9H8 876 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 CT55Q8WUE5 264 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ARL5BQ96KC2 179 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD7Q96MP8 289 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ZPBPQ9BS86 351 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 NDEL1Q9GZM8 345 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 NUAK2Q9H093 628 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SDHAF3Q9NRP4 125 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 TCFL5Q9UL49 500 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 DCTN6O00399 190 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 RNF13O43567 381 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 GLCEO94923 617 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 DLGAP3O95886 979 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC2LP0C7M8 214 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 OR2T7P0C7T2 308 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A1P53007 311 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 IL10RAQ13651 578 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF20Q5VT98 475 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 OR2T27Q8NH04 317 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ALG12Q9BV10 488 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL2Q9UKC9 423 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 OTX2P32243 289 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF417Q8TAU3 575 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms