RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 RPE65Q16518 533 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 WDFY2Q96P53 400 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.51□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SCN2AQ99250 2005 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 H3BML4 177 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 FKTNO75072 461 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 POU3F4P49335 361 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF529Q6P280 563 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 OR7G2Q8NG99 324 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CPXM2Q8N436 756 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CXorf58Q96LI9 332 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 FGF19O95750 216 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 PI3P19957 117 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 BSGP35613 385 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 AWAT2Q6E213 333 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 NCDNQ9UBB6 729 aa14.5□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 IRS1P35568 1242 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 FXYD4P59646 89 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 GLS2Q9UI32 602 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 A0A1B0GTH9 108 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 TSPAN15O95858 294 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 OR2T7P0C7T2 308 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 TEKQ02763 1124 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SVBPQ8N300 66 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 OR2T27Q8NH04 317 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 TMED6Q8WW62 240 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 KLHL15Q96M94 604 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 NIT2Q9NQR4 276 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF208O43345 1280 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CTNSO60931 367 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 EPXP11678 715 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CEBPBP17676 345 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 NUDT1P36639 197 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 USP53Q70EK8 1073 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 C12orf57Q99622 126 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.49□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CDC42EP2O14613 210 aa14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CBX7O95931 251 aa14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CD3DP04234 171 aa14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 SGCAQ16586 387 aa14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 DLL4Q9NR61 685 aa14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 TNK1Q13470 666 aa14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 MPEG1Q2M385 716 aa14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.48□□□□□ -0.09
USP43-201ENST00000285199 Q6ZTK2 550 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms