RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284073.6

MSI2-201, Transcript of musashi RNA binding protein 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI2, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2-201ENST00000284073 Q499Y3 187 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 HMX2A2RU54 273 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 NSDHLQ15738 373 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 LIPIQ6XZB0 460 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SCD5Q86SK9 330 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 BMFQ96LC9 184 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 STARD5Q9NSY2 213 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 FABP1P07148 127 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SRMP19623 302 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ZNF75AQ96N20 296 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 CACNA1FO60840 1977 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 DIO2Q92813 273 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 A0A1W2PQU0 124 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 TGOLN2O43493 480 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 TACR3P29371 465 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 GKN2Q86XP6 184 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 NMNAT3Q96T66 252 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 MED17Q9NVC6 651 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 C20orf202A1L168 122 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ACTL6BO94805 426 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ADH1BP00325 375 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 OR2T7P0C7T2 308 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 PSMB5P28074 263 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 CLDN20P56880 219 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 CAMK2DQ13557 499 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 OR2T27Q8NH04 317 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SERINC2Q96SA4 455 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ALG12Q9BV10 488 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SYT5O00445 386 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 UBL4AP11441 157 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 EFNA3P52797 238 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 EPHA5P54756 1037 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 KCTD11Q693B1 232 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.69□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 THBS1P07996 1170 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 OR5B2Q96R09 309 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ZNF724A8MTY0 619 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 XRCC3O43542 346 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 HAGHQ16775 308 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 RGRP47804 291 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ZNF480Q8WV37 535 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 YIPF6Q96EC8 236 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 WDR92Q96MX6 357 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 OR51B6Q9H340 312 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 A6NIZ1 184 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SGK494L7N484 410 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 LGI1O95970 557 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 KITLGP21583 273 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ADRA1AP35348 466 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 CTSCP53634 463 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 RAP1BP61224 184 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SPRYD7Q5W111 196 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 LCTLQ6UWM7 567 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.68□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms