RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 I3L1I5 382 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 ADRB1P08588 477 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 RAB40ALP0C0E4 278 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 APEHP13798 732 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 PRTGQ2VWP7 1150 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 OR4C3Q8NH37 302 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 RAB40AQ8WXH6 277 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 MARVELD3Q96A59 401 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SORCS2Q96PQ0 1159 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 HCN3Q9P1Z3 774 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 MOKQ9UQ07 419 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 RCE1Q9Y256 329 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SLC6A5Q9Y345 797 aa25.57■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 KRT33AO76009 404 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 ZFPL1O95159 310 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 CALCBP10092 127 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 DNASE1P24855 282 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 GRK6P43250 576 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 LEG1Q6P5S2 330 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SFTPA2Q8IWL1 248 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 LIPHQ8WWY8 451 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A18Q9H1K4 315 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 MTCH2Q9Y6C9 303 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 F5P12259 2224 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 CLDN4O14493 209 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 CTSBP07858 339 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 PNMTP11086 282 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 UQCRC1P31930 480 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 MTFR2Q6P444 385 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SLC16A9Q7RTY1 509 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 JAZF1Q86VZ6 243 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 CCDC28AQ8IWP9 274 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 BEST4Q8NFU0 473 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 OR11G2Q8NGC1 345 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 C16orf52Q8NHV5 167 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 FCAMRQ8WWV6 532 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 LIN7BQ9HAP6 207 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 HIF3AQ9Y2N7 669 aa25.56■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 IMPA2O14732 288 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 FUT7Q11130 342 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 GXYLT1Q4G148 440 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 FAM220AQ7Z4H9 259 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 C15orf40Q8WUR7 153 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 OIT3Q8WWZ8 545 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 NXPE2Q96DL1 559 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 MS4A3Q96HJ5 214 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SLITRK2Q9H156 845 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 AUP1Q9Y679 476 aa25.55■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 CRYZL1O95825 349 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SYPP08247 313 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 EPHA4P54764 986 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 HHEXQ03014 270 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 ELOA3BQ3SY89 546 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 KLHL26Q53HC5 615 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 TMEM31Q5JXX7 168 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 METTL11BQ5VVY1 283 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 WBP2NLQ6ICG8 309 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 FCRLAQ7L513 359 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 ELMOD2Q8IZ81 293 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 FAM71CQ8NEG0 241 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 ELOA3Q8NG57 546 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 OR52I2Q8NH67 350 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 MOSPD2Q8NHP6 518 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 OR10A5Q9H207 317 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 IDSB3KWA1 339 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 TFF2Q03403 129 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 NNATQ16517 81 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 TAF8Q7Z7C8 310 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 CD207Q9UJ71 328 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 ETV7Q9Y603 341 aa25.54■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GUH1 482 aa25.53■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa25.53■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 GMDSO60547 372 aa25.53■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 IFNA16P05015 189 aa25.53■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 CD14P08571 375 aa25.53■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 MNDAP41218 407 aa25.53■■□□□ 1.68
UBP1-201ENST00000283628 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms