RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 KIAA1456Q9P272 454 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TFAP2AP05549 437 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CD3GP09693 182 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TNFRSF1AP19438 455 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ACTA2P62736 377 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ACTG2P63267 376 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ACTC1P68032 377 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ACTA1P68133 377 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PXKQ7Z7A4 578 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 F2RL3Q96RI0 385 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ATF6BQ99941 703 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 FAM159BA6NKW6 160 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 UGDHO60701 494 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ADAM23O75077 832 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 GPR85P60893 370 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CDK6Q00534 326 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PCLAFQ15004 111 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ZFP82Q8N141 532 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 GJC3Q8NFK1 279 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PVRP15151 417 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PPP3CBP16298 524 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 BDKRB2P30411 391 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 LSSP48449 732 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 EFNA3P52797 238 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OPCMLQ14982 345 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.257e-7■■■■■ 28.7
USP3-201ENST00000268049 HMGN3Q15651 99 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CNIH2Q6PI25 160 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 DCUN1D4Q92564 292 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OR2M2Q96R28 347 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CHST8Q9H2A9 424 aa7.25□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 A8MT66 165 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 H0YIG0 161 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 J3QKU1 62 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 GPR75O95800 540 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OLFM2O95897 454 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 UFM1P61960 85 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CFHR1Q03591 330 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OR7A5Q15622 319 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
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USP3-201ENST00000268049 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 ZNF566Q969W8 418 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 MRI1Q9BV20 369 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 OR51I1Q9H343 314 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 F5P12259 2224 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 RGS11O94810 467 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 F10P00742 488 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 RD3LP0DJH9 198 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 PRF1P14222 555 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SPCS2Q15005 226 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 TMEM107Q6UX40 140 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 BEND4Q6ZU67 534 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 SPRED2Q7Z698 418 aa7.24□□□□□ -1.25
USP3-201ENST00000268049 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.24□□□□□ -1.25
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