RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 RASGRP3Q8IV61 690 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 OR4C15Q8NGM1 316 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 OR6M1Q8NGM8 313 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 GPR148Q8TDV2 347 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 FBLIM1Q8WUP2 373 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 OR1E3Q8WZA6 343 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 AMDHD1Q96NU7 426 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 PHB2Q99623 299 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 ATG2BQ96BY7 2078 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 MYOFQ9NZM1 2061 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 WRBO00258 174 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 SCDO00767 359 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 APOC1P02654 83 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 SFTPBP07988 381 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 HMGA2P52926 109 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 OR10A3P58181 314 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 HHEXQ03014 270 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 LAIR1Q6GTX8 287 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 C1orf94Q6P1W5 598 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 TMUB2Q71RG4 321 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 NUP54Q7Z3B4 507 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 NKAIN4Q8IVV8 208 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 GATSQ8NAP1 163 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2T4Q8NH00 348 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 PAQR8Q8TEZ7 354 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 S100PBPQ96BU1 408 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 LRRC46Q96FV0 321 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 CYSLTR2Q9NS75 346 aa10.65□□□□□ -0.7
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 B4GALT2O60909 372 aa10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 LSSP48449 732 aa10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ARHGDIBP52566 201 aa10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 LTBQ06643 244 aa10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 OR1Q1Q15612 314 aa10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 TTC9Q92623 222 aa10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ZDHHC12Q96GR4 267 aa10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 DGAT2Q96PD7 388 aa10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ANKRD19PQ9H560 264 aa10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF281Q9Y2X9 895 aa10.65□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF878C9JN71 531 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 LIPCP11150 499 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ADH6P28332 368 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 IL12BP29460 328 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 CBX5P45973 191 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 PPP2CBP62714 309 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 PPP2CAP67775 309 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 FOXK2Q01167 660 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF628Q5EBL2 1059 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF619Q8N2I2 560 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 SPEM1Q8N4L4 309 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM99Q8N816 258 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 DCUN1D4Q92564 292 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 IER2Q9BTL4 223 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 PRRG4Q9BZD6 226 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 NOX4Q9NPH5 578 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 SEMA4GQ9NTN9 838 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 CPNE7Q9UBL6 633 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 SERGEFQ9UGK8 458 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 C11orf98E9PRG8 122 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 SYPP08247 313 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 TNK1Q13470 666 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 IRF3Q14653 427 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 GDF7Q7Z4P5 450 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 CDRT4Q8N9R6 151 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ST8SIA2Q92186 375 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF700Q9H0M5 742 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 MIXL1Q9H2W2 232 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC25A19Q9HC21 320 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC23A2Q9UGH3 650 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 FLVCR2Q9UPI3 526 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF318Q5VUA4 2279 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC2A10O95528 541 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ACSM4P0C7M7 580 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2T7P0C7T2 308 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 TPT1P13693 172 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF250P15622 560 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 FUT1P19526 365 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 GZMMP51124 257 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 CTXN1P60606 82 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 MESP2Q0VG99 397 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM27D1Q5T7N8 215 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 NLRC3Q7RTR2 1065 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 SFTPA1Q8IWL2 248 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 STEAP2Q8NFT2 490 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2T27Q8NH04 317 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 OR52I2Q8NH67 350 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 GAL3ST3Q96A11 431 aa10.64□□□□□ -0.71
CLSTN3-201ENST00000266546 ZBTB8AQ96BR9 441 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms