RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 GXYLT1Q4G148 440 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 SFRP5Q5T4F7 317 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 ABHD13Q7L211 337 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 LHFPL5Q8TAF8 219 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 FKRPQ9H9S5 495 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 SNRPGP15A8MWD9 76 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 CYR61O00622 381 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 SUSD5O60279 629 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 ADH1BP00325 375 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 RAB40ALP0C0E4 278 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 GJA4P35212 333 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 RPL4P36578 427 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 TMEM81Q6P7N7 255 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 KIRREL2Q6UWL6 708 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 OR52B4Q8NGK2 314 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 RAB40AQ8WXH6 277 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 CTHRC1Q96CG8 243 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 SGTBQ96EQ0 304 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 OR2M4Q96R27 311 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 GPR174Q9BXC1 333 aa13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GVT2 93 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 PRSS38A1L453 326 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 ACOT7O00154 380 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 TSPAN4O14817 238 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 TNFSF14O43557 240 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 CBX7O95931 251 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 IGKV1D-16P01601 117 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 NMBP08949 121 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 CALCBP10092 127 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 TAS2R20P59543 309 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 FAM53BQ14153 422 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 CSRP2Q16527 193 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 TUSC1Q2TAM9 212 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 SLC35D3Q5M8T2 416 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 STAC2Q6ZMT1 411 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 SLC35F3Q8IY50 421 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 OR4N2Q8NGD1 307 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 OR52R1Q8NGF1 315 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 OR14C36Q8NHC7 312 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 BADQ92934 168 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 SLC22A18Q96BI1 424 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 RASD2Q96D21 266 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 EVA1AQ9H8M9 152 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 DPP7Q9UHL4 492 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 FAM171A2A8MVW0 826 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 TMEM127O75204 238 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 IFNA16P05015 189 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 NAGAP17050 411 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 CTRB1P17538 263 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 ART1P52961 327 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 PSG6Q00889 435 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 CBFBQ13951 182 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 ZNF684Q5T5D7 378 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 CTRB2Q6GPI1 263 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 ULK3Q6PHR2 472 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 FIGLAQ6QHK4 219 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 CAMKVQ8NCB2 501 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 MIB2Q96AX9 1013 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 MED9Q9NWA0 146 aa13.65□□□□□ -0.22
SYP-201ENST00000263233 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 VSIG10L2P0DP72 767 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ADRA2CP18825 462 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 MNDAP41218 407 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 IL10RAQ13651 578 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 KIR2DS3Q14952 304 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 PRRT3Q5FWE3 981 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 LINC01590Q5TEZ4 76 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 CCL4L1Q8NHW4 92 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 OR1F2PQ96R84 312 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 CD93Q9NPY3 652 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 C4orf47A7E2U8 309 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 H0YGG7 62 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SLC31A1O15431 190 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 HIST1H2ABP04908 130 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 KIAA1024LP59773 190 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ERVK-25P63136 954 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 ZBTB44Q8NCP5 570 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-201ENST00000263233 OR6M1Q8NGM8 313 aa13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms