RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000231526.8

TRAPPC13-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC13, Length 2,715 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13-201ENST00000231526 TGFAP01135 160 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 CLPSP04118 112 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 HBQ1P09105 142 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 IFNGR1P15260 489 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 BMP7P18075 431 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 NR4A1P22736 598 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 TUBG1P23258 451 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 IL12BP29460 328 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 CHRNA7P36544 502 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 CAPZA2P47755 286 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 OMPP47874 163 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 BMXP51813 675 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 SMSP52788 366 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 TSPAN5P62079 268 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 ST3GAL4Q11206 333 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 FGFBP1Q14512 234 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 SAMD5Q5TGI4 173 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 ACSM5Q6NUN0 579 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC27A4Q6P1M0 643 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PRSS48Q7RTY5 328 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 CDK20Q8IZL9 346 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 SVOPQ8N4V2 548 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 AMER2Q8N7J2 671 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PFN4Q8NHR9 129 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PERPQ96FX8 193 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF559Q9BR84 538 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 NUDT9Q9BW91 350 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 TSSK6Q9BXA6 273 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 DPH1Q9BZG8 443 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 NGBQ9NPG2 151 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 TUBG2Q9NRH3 451 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 UBQLN4Q9NRR5 601 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 C14orf105Q9NVL8 296 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 ADAMTS20P59510 1910 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 A0A1B0GWA3 101 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 FAM229AH3BQW9 127 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 TM4SF5O14894 197 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 CHP2O43745 196 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 STSP08842 583 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 CCL4P13236 92 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 IFI30P13284 250 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 GABRB1P18505 474 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PCMT1P22061 227 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 MAP2K4P45985 399 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 CDKN1BP46527 198 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PCYT1AP49585 367 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 MVKQ03426 396 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PLCXD2Q0VAA5 305 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF141Q15928 474 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PRAMEF20Q5VT98 475 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLX4IPQ5VYV7 408 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF613Q6PF04 617 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 SMARCD3Q6STE5 483 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 WDR88Q6ZMY6 472 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 LINC00696Q6ZRV3 163 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 COX15Q7KZN9 410 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PLPP5Q8NEB5 264 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR13F1Q8NGS4 319 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 THAP4Q8WY91 577 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 GGHQ92820 318 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 MYDGFQ969H8 173 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 ADIPOR1Q96A54 375 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PLEKHA8Q96JA3 519 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 LRR1Q96L50 414 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 Q96MT0 163 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 LPAR4Q99677 370 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PRSS27Q9BQR3 290 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC25A18Q9H1K4 315 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 C20orf141Q9NUB4 165 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 MED31Q9Y3C7 131 aa4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC13-201ENST00000231526 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.91□□□□□ -1.62
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