RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	BEND4	Q6ZU67	534 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM222B	Q8WU58	562 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	RHCG	Q9UBD6	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	OR2T1	O43869	369 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	EPX	P11678	715 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	SSTR2	P30874	369 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	LZIC	Q8WZA0	190 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	C14orf79	Q96F83	325 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	EPYC	Q99645	322 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	MED18	Q9BUE0	208 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	CD300A	Q9UGN4	299 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	AKAP9	Q99996	3911 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	GPR171	O14626	319 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	LYZL6	O75951	148 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	OR5F1	O95221	314 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	CH25H	O95992	272 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	CALB2	P22676	271 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	PEX19	P40855	299 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	UGT2B15	P54855	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	LGALS3BP	Q08380	585 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	IFI44L	Q53G44	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	PFN4	Q8NHR9	129 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	APH1A	Q96BI3	265 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	DACH2	Q96NX9	599 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003		A6NNC1	897 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	CASK	O14936	926 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	GMNN	O75496	209 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	SERPINI2	O75830	405 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	UBOX5	O94941	541 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	HPR	P00739	348 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	IFNW1	P05000	195 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	THBD	P07204	575 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	HLA-DOB	P13765	273 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	HSD17B1	P14061	328 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	IGHV1-2	P23083	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	SELENOP	P49908	381 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	MNAT1	P51948	309 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	FAP	Q12884	760 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	AAED1	Q7RTV5	226 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	NRGN	Q92686	78 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	S100PBP	Q96BU1	408 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	MPP4	Q96JB8	637 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARID1B-222	ENST00000637003	APC	P25054	2843 aa		13.4	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	ENO4	A6NNW6	628 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	MS4A18	H0YCH9	400 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	FFAR1	O14842	300 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	ARPC2	O15144	300 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	SIAH2	O43255	324 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	PIP5K1C	O60331	668 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	CTAG2	O75638	210 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARID1B-222	ENST00000637003	PDE5A	O76074	875 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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