RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	HSD17B8	Q92506	261 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	DERL3	Q96Q80	235 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NANS	Q9NR45	359 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT15	Q9NV35	164 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PRR32	B1ATL7	298 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SLC43A1	O75387	559 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	AHCY	P23526	432 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	DGCR2	P98153	550 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFA5	Q16718	116 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL26	Q53HC5	615 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	OTP	Q5XKR4	325 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TSLP	Q969D9	159 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NOX4	Q9NPH5	578 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RP1	P56715	2156 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf142	B7Z368	130 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	OGG1	O15527	345 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF749	O43361	778 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PPM1B	O75688	479 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINA3	P01011	423 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CLPS	P04118	112 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	HSD17B7	P56937	341 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CDON	Q4KMG0	1287 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CEP78	Q5JTW2	689 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ALG12	Q9BV10	488 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CACNG2	Q9Y698	323 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	IGFBP4	P22692	258 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FASLG	P48023	281 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN12	P56749	244 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CTXN1	P60606	82 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	HES5	Q5TA89	166 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CMIP	Q8IY22	773 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SYS1	Q8N2H4	156 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GDF15	Q99988	308 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ING3	Q9NXR8	418 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM72	A0PK05	275 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	DCTN6	O00399	190 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SCD	O00767	359 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV3-19	P01714	112 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ADRB1	P08588	477 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	UBL4A	P11441	157 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MST1	P26927	711 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PRPS1	P60891	318 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FAP	Q12884	760 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GAS6	Q14393	721 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PRODH2	Q9UF12	536 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0A6YYJ9	748 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TVP23A	A6NH52	213 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TNFRSF10A	O00220	468 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	BTC	P35070	178 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GABRA4	P48169	554 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SLC36A2	Q495M3	483 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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