RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ARPC3O15145 178 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2G5P39877 138 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ARG2P78540 354 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGFQ07326 219 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RAET1LQ5VY80 246 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RELTQ969Z4 430 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGQQ9BRB3 760 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL1Q9NR64 748 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NCKAP5O14513 1909 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPT2A6NK58 231 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CD46P15529 392 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC15A1P46059 708 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GALT5-AS1P59052 145 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 MYBPHQ13203 477 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 AADACL4Q5VUY2 407 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKK1Q8NFD2 765 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC39A7Q92504 469 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SCMH1Q96GD3 660 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 KATNB1Q9BVA0 655 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ASPNQ9BXN1 380 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2B2Q9GZK3 357 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM185BQ9H7F4 350 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVK-18Q9QC07 812 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 DKK4Q9UBT3 224 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A5Q9Y345 797 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 M0R082 166 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 IDH3BO43837 385 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CD14P08571 375 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 APEHP13798 732 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SHC1P29353 583 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NOS3P29474 1203 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 TOMM20Q15388 145 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 OR7A5Q15622 319 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 AHSA2Q719I0 299 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SCAIQ8N9R8 606 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF417Q8TAU3 575 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 DTNBP1Q96EV8 351 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf34Q96MH7 638 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SIGLEC11Q96RL6 698 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NDEL1Q9GZM8 345 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PLPP3O14495 311 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PRODHO43272 600 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 GDF1P27539 372 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NR1H2P55055 460 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CTXN1P60606 82 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVK-25P63136 954 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PMS2P3Q13401 168 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NXNL2Q5VZ03 156 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM122BQ7Z309 247 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SPARTQ8N0X7 666 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 OR14L1PQ8NHC6 308 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 COPS4Q9BT78 406 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 TAPBPLQ9BX59 468 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ALKBH4Q9NXW9 302 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SPTBN2O15020 2390 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RIIAD1A6NNX1 92 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 IMPA2O14732 288 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS10O43665 173 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNGP01579 166 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 OPN1LWP04000 364 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 F13BP05160 661 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ADORA3P0DMS8 318 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 DBTP11182 482 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFSF10P50591 281 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 C19orf57Q0VDD7 668 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CPOQ8IVL8 374 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5B2Q96R09 309 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 B4GALT7Q9UBV7 327 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL21Q9UJP4 597 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFHX4Q86UP3 3567 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB10A6NFE3 127 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM183AA6NL82 134 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TXNDC12O95881 172 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 PIPP12273 146 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF3P17036 446 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-215ENST00000628018 SFTPDP35247 375 aa22.38■■□□□ 1.17
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