RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622967.1

AC055717.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AC055717.3, Length 595 nt, Biotype TEC.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC055717.3-201ENST00000622967 CCDC103Q8IW40 242 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 BBS10Q8TAM1 723 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 PROX1Q92786 737 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SLC35B4Q969S0 331 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 ZG16BQ96DA0 208 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 TMEM19Q96HH6 336 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 MUS81Q96NY9 551 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.74□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 CIB4A0PJX0 185 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SULT2B1O00204 365 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 ITGA5P08648 1049 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 EFNA4P52798 201 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 MERTKQ12866 999 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 MAPRE2Q15555 327 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 KRT73Q86Y46 540 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 ARL5BQ96KC2 179 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SOX7Q9BT81 388 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 VAPAQ9P0L0 249 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.73□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 CDHR4A6H8M9 788 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 CFAP73A6NFT4 308 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 PDLIM1O00151 329 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SLC22A2O15244 555 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 ETS2P15036 469 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 GPX2P18283 190 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SRD5A1P18405 259 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 GGTLC2Q14390 218 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 MAPK11Q15759 364 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 COQ5Q5HYK3 327 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 C1orf159Q96HA4 380 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 DNPH1O43598 174 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 NPPAP01160 153 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 ARAFP10398 606 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 RYKP34925 604 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 COPZ1P61923 177 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 RBBP4Q09028 425 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 PDK3Q15120 406 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SYT14P1Q58G82 188 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 REEP3Q6NUK4 255 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 ZNF544Q6NX49 715 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 APH1AQ96BI3 265 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 C3orf49Q96BT1 292 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SH3GL1Q99961 368 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 ASB6Q9NWX5 421 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.71□□□□□ -0.05
AC055717.3-201ENST00000622967 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 CLDN24A6NM45 220 aa14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 SLC6A2P23975 617 aa14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 SLC1A3P43003 542 aa14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 NR4A2P43354 598 aa14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 GZMKP49863 264 aa14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 CDK6Q00534 326 aa14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 EPS8Q12929 822 aa14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 NFYCQ13952 458 aa14.7□□□□□ -0.06
AC055717.3-201ENST00000622967 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms