RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 LINGO2Q7L985 606 aa21.69■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A13Q9NSD5 602 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 P2RX2Q9UBL9 471 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 OR6C65A6NJZ3 312 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 B9A039 149 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 NPIPB7O75200 414 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 C3orf36Q3SXR2 165 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 C1orf140Q5VVS0 124 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 EPHX4Q8IUS5 362 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 MREGQ8N565 214 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 ANKS4BQ8N8V4 417 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB18Q99592 522 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 UPK3AO75631 287 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 WDR93Q6P2C0 686 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 NIPAL3Q6P499 406 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 SLC38A5Q8WUX1 472 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 CHST2Q9Y4C5 530 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 BCHEP06276 602 aa21.65■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 EPHA3P29320 983 aa21.65■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa21.65■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF540Q8NDQ6 660 aa21.65■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 STK35Q8TDR2 534 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf24Q9BVV8 132 aa21.65■■□□□ 1.06
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PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PPZ6 126 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRF-216ENST00000617451 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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PTPRF-216ENST00000617451 VHLLQ6RSH7 139 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINA11Q86U17 422 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 MFSD8Q8NHS3 518 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA9Q9BWV2 254 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 BPESC1Q9GZL8 116 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SEC61A2Q9H9S3 476 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.64■■□□□ 1.05
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