RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TAF10	Q12962	218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PON3	Q15166	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SPESP1	Q6UW49	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CYS1	Q717R9	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ART4	Q93070	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	COPS4	Q9BT78	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	HIDE1	A8MVS5	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594		C9J4A7	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594		G3V3Y1	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ACOX3	O15254	700 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FZD7	O75084	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RFPL2	O75678	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MED26	O95402	600 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RHOC	P08134	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MYOG	P15173	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NDUFB7	P17568	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FAS	P25445	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SSTR4	P31391	388 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	DDOST	P39656	456 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FUT6	P51993	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	DLX5	P56178	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OR2B8P	P59922	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZP1	P60852	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TLE4	Q04727	773 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RGS1	Q08116	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TRAF3	Q13114	568 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	GPR17	Q13304	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FLOT2	Q14254	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	UPP1	Q16831	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594		Q6ZRG5	221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MREG	Q8N565	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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