RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CDHR4A6H8M9 788 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV1-44P01699 117 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 IL12AP29459 219 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL14P50914 215 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 SQLEQ14534 574 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 NIPAL3Q6P499 406 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF836Q6ZNA1 936 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHX4Q8IUS5 362 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX5LQ8IYB4 626 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF440Q8IYI8 595 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIML2Q8N7C3 387 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 TAPBPLQ9BX59 468 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 STAMBPO95630 424 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 IL2RGP31785 369 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSWIM7Q19AV6 140 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF621Q6ZSS3 439 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC34Q8IZ02 419 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF540Q8NDQ6 660 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MVM7 634 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 CELA3BP08861 270 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC1A6P48664 564 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 HGFACQ04756 655 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf36Q3SXR2 165 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf140Q5VVS0 124 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 WBP2NLQ6ICG8 309 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52P1PQ8NH57 321 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf159Q96HA4 380 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB1BQ9H0U4 201 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 MEAF6Q9HAF1 191 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 DSPPQ9NZW4 1301 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPB7O75200 414 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 VAMP5O95183 116 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV3-15P01624 115 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PGRP06401 933 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PRG2P13727 222 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PAX7P23759 505 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 GIFP27352 417 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 VSNL1P62760 191 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 LIN52Q52LA3 116 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 LIPNQ5VXI9 398 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 OGFOD2Q6N063 350 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP37Q8NFH4 326 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4F15Q8NGB8 312 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52E6Q96RD3 313 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00470Q9BZP3 86 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 AIG1Q9NVV5 245 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 HAO1Q9UJM8 370 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RASD1Q9Y272 281 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 hCG_2039718K7EN88 272 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 BIRC5O15392 142 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 DAOP14920 347 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 THBS4P35443 961 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 MVDP53602 400 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM8Q8N371 416 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 SVOPLQ8N434 492 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 DOK1Q99704 481 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF442Q9H7R0 627 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A13Q9NSD5 602 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PNPOQ9NVS9 261 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST2Q9Y4C5 530 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6C65A6NJZ3 312 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM229AB2RXF0 380 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRA1O75019 489 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 TACSTD2P09758 323 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 TFPTP0C1Z6 253 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 BGNP21810 368 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 COPZ1P61923 177 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 CLIP4Q8N3C7 705 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM169BQ8N8A8 192 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RX2Q9UBL9 471 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 FTCDNL1E5RQL4 147 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 BCHEP06276 602 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PNMTP11086 282 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ETFAP13804 333 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 APEX1P27695 318 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CHN2P52757 468 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF220Q5VTB9 566 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RFLNBQ8N5W9 214 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX18Q96RF0 628 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PTDSS2Q9BVG9 487 aa22.2■■□□□ 1.14
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