RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SLC47A1Q96FL8 570 aa17.75■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 PERPQ96FX8 193 aa17.75■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 BOD1Q96IK1 185 aa17.75■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 RADILQ96JH8 1075 aa17.75■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 C18orf12Q96KH6 178 aa17.75■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa17.75■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 NPAP1Q9NZP6 1156 aa17.75■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SLC13A4Q9UKG4 626 aa17.75■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 OR6C65A6NJZ3 312 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 C8BP07358 591 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 DANCRP0C864 163 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 MPGP29372 298 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 ARFIP2P53365 341 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 DMTNQ08495 405 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SELPLGQ14242 412 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 FAM69AQ5T7M9 428 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM108Q6UXF1 575 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 OR52N5Q8NH56 324 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SLC25A36Q96CQ1 311 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 PRR14Q9BWN1 585 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM27Q9HBJ8 222 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa17.74■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 A0A087WUJ7 227 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 M0QX08 132 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 FBP2O00757 339 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 TPST2O60704 377 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 LGI1O95970 557 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 PTAFRP25105 342 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 NCALDP61601 193 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 OR1Q1Q15612 314 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 KLHL17Q6TDP4 642 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 EPHX4Q8IUS5 362 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 WDR31Q8NA23 367 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 KBTBD8Q8NFY9 601 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 OR6S1Q8NH40 331 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 NEUROG1Q92886 237 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 TAAR8Q969N4 342 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SELENONQ9NZV5 590 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 MGAT4BQ9UQ53 548 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 LAMP3Q9UQV4 416 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa17.73■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 A0A0B4J2E0 115 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 A0A1B0GX12 115 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SHISA9B4DS77 424 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 OVOL3O00110 214 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 FMO6PO60774 539 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 NPPAP01160 153 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 GZMMP51124 257 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 MFSD13AQ14CX5 517 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 DUSP7Q16829 419 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 COQ5Q5HYK3 327 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 NANOGP8Q6NSW7 305 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 BIVMQ86UB2 503 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 OR10A6Q8NH74 314 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 OXGR1Q96P68 337 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SH3GL1Q99961 368 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 WFDC6Q9BQY6 131 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC134Q9H6E4 229 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 NANOGQ9H9S0 305 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SLC17A5Q9NRA2 495 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 AMDHD2Q9Y303 409 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 PLCE1Q9P212 2302 aa17.72■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 ABCD4O14678 606 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 AIM2O14862 343 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SOD3P08294 240 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 VIMP08670 466 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 INHBBP09529 407 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF43P17038 809 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 PCGF2P35227 344 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 C9orf135Q5VTT2 229 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 CGB2Q6NT52 195 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SMYD1Q8NB12 490 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 Q96MF0 132 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 EPYCQ99645 322 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGDIGQ99819 225 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 BDH2Q9BUT1 245 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 LINC00470Q9BZP3 86 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 GRIP2Q9C0E4 1043 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 SAR1AQ9NR31 198 aa17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
GIPC1-211ENST00000589631 A0A1W2PR80 420 aa17.7■□□□□ 0.42
GIPC1-211ENST00000589631 BBIP1A8MTZ0 92 aa17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms