RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589537.1

NFIC-208, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 2

Gene NFIC, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-208ENST00000589537 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.62□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 A0A1B0GWA3 101 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 AIM2O14862 343 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 KRT33AO76009 404 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 P2RY4P51582 365 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 EGR4Q05215 589 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ETFDHQ16134 617 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 COQ5Q5HYK3 327 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 RETREG3Q86VR2 466 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 OR52N5Q8NH56 324 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 BOD1Q96IK1 185 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SH3GL1Q99961 368 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 RCE1Q9Y256 329 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.61□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 DSCAMO60469 2012 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ABCD4O14678 606 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 FMO6PO60774 539 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 MFN2O95140 757 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 WNT11O96014 354 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 NPPAP01160 153 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 C8BP07358 591 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 INHBBP09529 407 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ZNF43P17038 809 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 HTR2AP28223 471 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 AQP1P29972 269 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 CDH11P55287 796 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ATP5J2P56134 94 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 MAPRE2Q15555 327 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PTOV1Q86YD1 416 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 Q96MF0 132 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ALG2Q9H553 416 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.6□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 A0A087WUJ7 227 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 A0A0B4J2E0 115 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 A0A1B0GX12 115 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 OVOL3O00110 214 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 TPST1O60507 370 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 DANCRP0C864 163 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PCGF2P35227 344 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ARFIP2P53365 341 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 MTPNP58546 118 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 PRPS1P60891 318 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 OR1Q1Q15612 314 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 OXGR1Q96P68 337 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NFIC-208ENST00000589537 SHISA9B4DS77 424 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 LGI1O95970 557 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 CD40P25942 277 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 ZNF83P51522 516 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 DMTNQ08495 405 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 MMEL1Q495T6 779 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 AGAP6Q5VW22 663 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 ZNF613Q6PF04 617 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 DTX2Q86UW9 622 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 COMTD1Q86VU5 262 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.58□□□□□ -0.08
NFIC-208ENST00000589537 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms