RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC1A7O00341 560 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC6AO75865 159 aa27.95■■■□□ 2.06
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CAPNS1-206ENST00000588815 CRHBPP24387 322 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL4P36578 427 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 TMPRSS3P57727 454 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 GABARAPL2P60520 117 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXK1P85037 733 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 MYBPHQ13203 477 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ALG10Q5BKT4 473 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5M1Q8NGP8 315 aa27.95■■■□□ 2.06
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CAPNS1-206ENST00000588815 ACOT7O00154 380 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXK2Q01167 660 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
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CAPNS1-206ENST00000588815 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa27.94■■■□□ 2.06
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CAPNS1-206ENST00000588815 MCIDASD6RGH6 385 aa27.93■■■□□ 2.06
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CAPNS1-206ENST00000588815 PMS2P3Q13401 168 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 OR7A5Q15622 319 aa27.93■■■□□ 2.06
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CAPNS1-206ENST00000588815 SFXN2Q96NB2 322 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5B2Q96R09 309 aa27.93■■■□□ 2.06
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CAPNS1-206ENST00000588815 MED12Q93074 2177 aa27.93■■■□□ 2.06
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CAPNS1-206ENST00000588815 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
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CAPNS1-206ENST00000588815 TMPPEQ6ZT21 453 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM251Q8N6I4 163 aa27.92■■■□□ 2.06
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CAPNS1-206ENST00000588815 INIPQ9NRY2 104 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 AASSQ9UDR5 926 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-206ENST00000588815 SULT2B1O00204 365 aa27.89■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TXNDC12O95881 172 aa27.89■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 DIO1P49895 249 aa27.89■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 PUDPQ08623 228 aa27.89■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 GXYLT1Q4G148 440 aa27.89■■■□□ 2.05
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