RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 KRT33AO76009 404 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 AHSA1O95433 338 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PLAUP00749 431 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CD3EP07766 207 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ARAFP10398 606 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 GPX2P18283 190 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 GGT1P19440 569 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV1-2P23083 117 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 EDNRAP25101 427 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PRKAR1BP31321 381 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MTPNP58546 118 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 H3F3AP84243 136 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 IL1RL1Q01638 556 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TAB1Q15750 504 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 AAED1Q7RTV5 226 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf111Q8N326 155 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM99Q8N816 258 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 HIPK4Q8NE63 616 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ELOA3Q8NG57 546 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 STON2Q8WXE9 905 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ITFG2Q969R8 447 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 NSL1Q96IY1 281 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CGREF1Q99674 301 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ASB6Q9NWX5 421 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 LIPT2A6NK58 231 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 M0QX08 132 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TPST1O60507 370 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC16A1P53985 500 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ADAM8P78325 824 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC17A1Q14916 467 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PPA1Q15181 289 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SMYD1Q8NB12 490 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 OR10A6Q8NH74 314 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 STK35Q8TDR2 534 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TSPEARQ8WU66 669 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35B4Q969S0 331 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C3orf49Q96BT1 292 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PERPQ96FX8 193 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PRR14Q9BWN1 585 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM2Q9C040 744 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PIF1Q9H611 641 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MRGBPQ9NV56 204 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 NF1P21359 2839 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GWA3 101 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PR80 420 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 OR5H1A6NKK0 313 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 AQP7P3A6NL99 342 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 HS3ST1O14792 307 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T1O43869 369 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 KRT34O76011 436 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 VAMP5O95183 116 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 OPN1SWP03999 348 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PNMTP11086 282 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 CBLP22681 906 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 HOXC12P31275 282 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 NTF4P34130 210 aa7.34□□□□□ -1.23
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